Protein–RNA interactions for Protein: H3BUS1

SYS1-DBNDD2, SYS1-DBNDD2 readthrough (NMD candidate), humanhuman

Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TMA16P2-201ENST00000413187 601 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL691515.2-201ENST00000414765 466 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC243547.1-201ENST00000415065 408 ntTSL 2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TMSB10P1-201ENST00000415070 132 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LINC00316-201ENST00000416722 455 ntTSL 2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MAGEB6P1-201ENST00000416929 1224 ntAPPRIS P1 BASIC4.95□□□□□ -1.62
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MICU1-204ENST00000418483 1212 ntTSL 2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LIX1L-AS1-203ENST00000421764 287 ntTSL 2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC006455.7-201ENST00000422502 392 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AP001342.1-201ENST00000423389 525 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FO393418.1-201ENST00000424761 510 ntTSL 4 BASIC4.95□□□□□ -1.62
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC073342.1-201ENST00000427392 592 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
SYS1-DBNDD2H3BUS1 BACE2-IT1-201ENST00000433378 382 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LINC01732-201ENST00000435023 542 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TTC28-AS1-216ENST00000437713 854 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC084809.2-201ENST00000444464 512 ntTSL 2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GRM8-206ENST00000444921 1251 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC093157.1-205ENST00000449473 1298 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RPS26P11-201ENST00000463445 348 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RN7SL869P-201ENST00000497032 300 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
SYS1-DBNDD2H3BUS1 IGLV3-13-201ENST00000518475 223 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HDAC2-AS2-211ENST00000520034 790 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZNF726-203ENST00000525354 806 ntTSL 2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC109635.2-202ENST00000529219 500 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PSMA6-202ENST00000540871 912 ntTSL 2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC140847.2-201ENST00000545923 501 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PSMA3-AS1-211ENST00000556225 839 ntTSL 4 BASIC4.95□□□□□ -1.62
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC007907.1-201ENST00000557953 451 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MORF4L1-205ENST00000558502 855 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ARL6IP1-204ENST00000562819 578 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC090518.1-202ENST00000568246 578 ntTSL 4 BASIC4.95□□□□□ -1.62
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC110921.1-201ENST00000577544 612 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ANKRD20A5P-203ENST00000580200 566 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MIR3194-201ENST00000582236 73 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SRP68P1-201ENST00000584247 269 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RPS27AP19-201ENST00000597285 458 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC112493.1-201ENST00000609836 303 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
SYS1-DBNDD2H3BUS1 Six3os1_4.1-201ENST00000615706 324 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RN7SL113P-201ENST00000619959 299 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AP005242.3-201ENST00000623604 607 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL356095.2-201ENST00000624025 457 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LINC01359-205ENST00000634604 1050 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
SYS1-DBNDD2H3BUS1 OR2J1-202ENST00000641659 2144 ntAPPRIS P1 BASIC4.95□□□□□ -1.62
SYS1-DBNDD2H3BUS1 UTP15-208ENST00000543251 4922 ntTSL 2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CHD2-215ENST00000628375 3202 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
SYS1-DBNDD2H3BUS1 IL15-203ENST00000394159 1545 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PUS3-203ENST00000530811 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SGO2-201ENST00000357799 4214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MACF1-232ENST00000567887 24319 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CUL4B-201ENST00000336592 3109 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AKAP5-202ENST00000394718 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PTBP3-202ENST00000334318 7990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LINC01741-201ENST00000427173 1666 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC007485.2-201ENST00000623493 1667 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
SYS1-DBNDD2H3BUS1 VRK2-206ENST00000435505 2446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ENPP2-208ENST00000522826 2667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ENPP2-201ENST00000075322 2651 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PHACTR2-207ENST00000427704 9531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SAMD9L-202ENST00000411955 5831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
SYS1-DBNDD2H3BUS1 WDR72-208ENST00000614174 4224 ntTSL 2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL121594.3-201ENST00000557565 3857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC137056.2-201ENST00000624055 1958 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DYNC1I2-202ENST00000397119 2604 ntTSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FAM186A-203ENST00000543096 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.94□□□□□ -1.62
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TLR10-208ENST00000622002 3673 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.94□□□□□ -1.62
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FRAS1-207ENST00000512123 15624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RFX3-212ENST00000617270 9253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.94□□□□□ -1.62
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LINC01441-201ENST00000433766 2290 ntTSL 2 BASIC4.94□□□□□ -1.62
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CA10-204ENST00000570565 2276 ntTSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
SYS1-DBNDD2H3BUS1 C1D-202ENST00000407324 1379 ntTSL 3 BASIC4.94□□□□□ -1.62
SYS1-DBNDD2H3BUS1 EEF1A1P9-201ENST00000514975 1383 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NLRP3P1-201ENST00000622303 1785 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CLEC12A-201ENST00000304361 1549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL157713.1-201ENST00000379752 1531 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TESPA1-210ENST00000531122 1517 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.94□□□□□ -1.62
SYS1-DBNDD2H3BUS1 INO80D-201ENST00000403263 14136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
SYS1-DBNDD2H3BUS1 WDCP-201ENST00000295148 3817 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC4.94□□□□□ -1.62
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PSMD10-203ENST00000340200 713 ntTSL 3 BASIC4.94□□□□□ -1.62
SYS1-DBNDD2H3BUS1 OR10A3-201ENST00000360759 1061 ntAPPRIS P1 BASIC4.94□□□□□ -1.62
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RN7SKP186-201ENST00000365371 303 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RNA5SP207-201ENST00000390874 107 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PPM1N-202ENST00000396736 527 ntTSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC234778.1-201ENST00000399253 370 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NDUFV2-202ENST00000400033 942 ntTSL 3 BASIC4.94□□□□□ -1.62
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CES5AP1-201ENST00000400418 859 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC006017.1-201ENST00000424630 673 ntTSL 3 BASIC4.94□□□□□ -1.62
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TRBV10-2-201ENST00000426318 395 ntAPPRIS P1 BASIC4.94□□□□□ -1.62
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC132217.1-201ENST00000430034 373 ntTSL 3 BASIC4.94□□□□□ -1.62
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC116038.1-201ENST00000432250 408 ntTSL 3 BASIC4.94□□□□□ -1.62
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HNRNPA1P18-201ENST00000433537 927 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL590094.1-203ENST00000435649 828 ntTSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LINC00350-201ENST00000438640 422 ntTSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
SYS1-DBNDD2H3BUS1 snoU13.29-201ENST00000459370 104 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RN7SL251P-201ENST00000464175 297 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RN7SL36P-201ENST00000469345 276 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ACPP-203ENST00000475741 1242 ntTSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC096743.1-201ENST00000485172 319 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GAPDHP47-201ENST00000489113 999 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC116359.1-201ENST00000510731 1099 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC108727.2-201ENST00000512277 392 ntTSL 3 BASIC4.94□□□□□ -1.62
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