Protein–RNA interactions for Protein: Q86TL0

ATG4D, Cysteine protease ATG4D, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4DQ86TL0 NPM1P25-201ENST00000429734 854 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
ATG4DQ86TL0 MED28P4-201ENST00000433137 572 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
ATG4DQ86TL0 AC098828.1-201ENST00000436164 440 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
ATG4DQ86TL0 LINC01865-202ENST00000436808 853 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
ATG4DQ86TL0 MIATNB-204ENST00000437071 1006 ntTSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
ATG4DQ86TL0 AL606490.8-201ENST00000441624 319 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
ATG4DQ86TL0 AC138089.1-201ENST00000450847 967 ntTSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
ATG4DQ86TL0 MIR4500HG-204ENST00000453832 827 ntTSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
ATG4DQ86TL0 AC007547.2-201ENST00000468802 360 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
ATG4DQ86TL0 RN7SL368P-201ENST00000473384 277 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
ATG4DQ86TL0 RN7SL685P-201ENST00000476271 298 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
ATG4DQ86TL0 AC079910.1-201ENST00000477099 749 ntTSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
ATG4DQ86TL0 RN7SL608P-201ENST00000492377 279 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
ATG4DQ86TL0 TMEM196-205ENST00000493519 687 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
ATG4DQ86TL0 AC006063.1-201ENST00000512511 560 ntTSL 4 BASIC7.29□□□□□ -1.24
ATG4DQ86TL0 SDHC-208ENST00000513009 369 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
ATG4DQ86TL0 FABP5P12-201ENST00000515543 389 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
ATG4DQ86TL0 AC108515.1-201ENST00000517407 525 ntTSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
ATG4DQ86TL0 CCL26-201ENST00000005180 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
ATG4DQ86TL0 RPL12P22-201ENST00000519073 490 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
ATG4DQ86TL0 AC060788.1-201ENST00000521318 469 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
ATG4DQ86TL0 OPRK1-204ENST00000524278 1195 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
ATG4DQ86TL0 OR5M11-201ENST00000528616 1020 ntAPPRIS P1 BASIC7.29□□□□□ -1.24
ATG4DQ86TL0 SOX9-AS1-214ENST00000540802 578 ntTSL 4 BASIC7.29□□□□□ -1.24
ATG4DQ86TL0 ANAPC15-213ENST00000543050 807 ntTSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
ATG4DQ86TL0 AC024224.2-201ENST00000544225 782 ntTSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
ATG4DQ86TL0 LINC02448-201ENST00000548613 583 ntTSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
ATG4DQ86TL0 LINC02325-202ENST00000554260 567 ntTSL 4 BASIC7.29□□□□□ -1.24
ATG4DQ86TL0 AL355922.4-201ENST00000555642 449 ntTSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
ATG4DQ86TL0 CCDC32-212ENST00000560305 557 ntTSL 4 BASIC7.29□□□□□ -1.24
ATG4DQ86TL0 AL512428.1-201ENST00000562221 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
ATG4DQ86TL0 AC136624.3-201ENST00000571660 567 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
ATG4DQ86TL0 AC007014.1-201ENST00000572828 610 ntTSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
ATG4DQ86TL0 DPRXP4-201ENST00000578053 568 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
ATG4DQ86TL0 AC005495.1-201ENST00000586611 1211 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
ATG4DQ86TL0 RPS11-202ENST00000594493 575 ntTSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
ATG4DQ86TL0 AC008537.2-201ENST00000596135 482 ntTSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
ATG4DQ86TL0 AC084373.1-201ENST00000603311 235 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
ATG4DQ86TL0 AP000254.1-201ENST00000609934 520 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
ATG4DQ86TL0 AL137246.2-201ENST00000613439 662 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
ATG4DQ86TL0 Metazoa_SRP.39-201ENST00000614194 271 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
ATG4DQ86TL0 AC098590.2-201ENST00000614787 281 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
ATG4DQ86TL0 CU634019.6-201ENST00000623165 710 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
ATG4DQ86TL0 LINC02109-206ENST00000629527 854 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
ATG4DQ86TL0 AL049541.1-201ENST00000630976 642 ntTSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
ATG4DQ86TL0 AC141930.3-201ENST00000640435 762 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
ATG4DQ86TL0 AC016251.1-201ENST00000624299 4198 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
ATG4DQ86TL0 C8orf37-201ENST00000286688 3334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
ATG4DQ86TL0 MED23-209ENST00000539158 1636 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
ATG4DQ86TL0 KLRC1-207ENST00000544822 1600 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
ATG4DQ86TL0 BBS12-203ENST00000542236 3431 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
ATG4DQ86TL0 AL161725.1-201ENST00000591577 1351 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
ATG4DQ86TL0 DIS3L2-202ENST00000325385 3501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
ATG4DQ86TL0 UTY-209ENST00000537580 6490 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
ATG4DQ86TL0 C8orf22-201ENST00000303202 1499 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
ATG4DQ86TL0 AC087203.2-201ENST00000526502 1587 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
ATG4DQ86TL0 ERI2-215ENST00000569729 2646 ntTSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
ATG4DQ86TL0 AC016582.1-202ENST00000636341 2982 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
ATG4DQ86TL0 LRRC4C-202ENST00000527150 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
ATG4DQ86TL0 URB1-201ENST00000382751 10832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
ATG4DQ86TL0 TMPRSS11D-201ENST00000283916 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
ATG4DQ86TL0 FO393401.2-201ENST00000422009 1307 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
ATG4DQ86TL0 PCDH18-205ENST00000511115 1331 ntTSL 2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
ATG4DQ86TL0 CR383656.5-201ENST00000547616 1340 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
ATG4DQ86TL0 ADH7-205ENST00000482593 1420 ntTSL 3 BASIC7.28□□□□□ -1.24
ATG4DQ86TL0 AC089984.1-201ENST00000552780 1431 ntTSL 3 BASIC7.28□□□□□ -1.24
ATG4DQ86TL0 MITF-214ENST00000472437 1995 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
ATG4DQ86TL0 GRIA2-201ENST00000264426 3445 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
ATG4DQ86TL0 FPR3-201ENST00000339223 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
ATG4DQ86TL0 RNU6-792P-201ENST00000363490 107 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
ATG4DQ86TL0 RNU6-1214P-201ENST00000363650 109 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
ATG4DQ86TL0 RN7SKP76-201ENST00000364419 323 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
ATG4DQ86TL0 SNORA27.3-201ENST00000364937 134 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
ATG4DQ86TL0 LEMD1-203ENST00000367152 741 ntTSL 2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
ATG4DQ86TL0 SNORD3J-201ENST00000408473 190 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
ATG4DQ86TL0 SLC4A1APP1-201ENST00000419995 602 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
ATG4DQ86TL0 AL133325.1-201ENST00000421090 382 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
ATG4DQ86TL0 PTP4A1P7-201ENST00000423476 514 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
ATG4DQ86TL0 KRTAP9-11P-201ENST00000431013 525 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
ATG4DQ86TL0 NEFLP1-201ENST00000436364 984 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
ATG4DQ86TL0 OSBPL10-AS1-204ENST00000436598 513 ntTSL 3 BASIC7.28□□□□□ -1.24
ATG4DQ86TL0 AL139327.2-202ENST00000437057 400 ntTSL 3 BASIC7.28□□□□□ -1.24
ATG4DQ86TL0 HIPK1-AS1-203ENST00000441071 571 ntTSL 3 BASIC7.28□□□□□ -1.24
ATG4DQ86TL0 DDX3X-202ENST00000441189 1051 ntTSL 2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
ATG4DQ86TL0 AL096829.2-201ENST00000446582 742 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
ATG4DQ86TL0 LINC01201-202ENST00000451431 401 ntTSL 3 BASIC7.28□□□□□ -1.24
ATG4DQ86TL0 RPS27AP8-201ENST00000452665 445 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
ATG4DQ86TL0 TXNP3-201ENST00000454560 301 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
ATG4DQ86TL0 LINC00709-201ENST00000458168 494 ntTSL 2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
ATG4DQ86TL0 GRM7-AS3-209ENST00000458713 454 ntTSL 3 BASIC7.28□□□□□ -1.24
ATG4DQ86TL0 AC092754.2-201ENST00000463506 460 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
ATG4DQ86TL0 AC008427.1-201ENST00000503102 655 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
ATG4DQ86TL0 ATG10-AS1-201ENST00000504846 648 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
ATG4DQ86TL0 AC093297.2-207ENST00000505401 692 ntTSL 3 BASIC7.28□□□□□ -1.24
ATG4DQ86TL0 RNU7-179P-201ENST00000516608 68 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
ATG4DQ86TL0 SNORA76.2-201ENST00000517095 137 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
ATG4DQ86TL0 AP000926.4-201ENST00000527351 454 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
ATG4DQ86TL0 AP000435.1-201ENST00000528539 496 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
ATG4DQ86TL0 RRAS2-205ENST00000529237 1278 ntTSL 2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
ATG4DQ86TL0 AP003306.1-201ENST00000529875 353 ntTSL 2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.5 ms