Protein–RNA interactions for Protein: P28827

PTPRM, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, humanhuman

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Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRMP28827 MIPOL1-202ENST00000396294 6258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
PTPRMP28827 CCDC113-202ENST00000443128 5110 ntTSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
PTPRMP28827 TRPM3-212ENST00000396283 3484 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
PTPRMP28827 MAP3K13-209ENST00000443863 3025 ntTSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
PTPRMP28827 DIP2C-202ENST00000381496 7749 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
PTPRMP28827 MEPE-208ENST00000540395 2135 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC10.21□□□□□ -0.77
PTPRMP28827 ZNF667-206ENST00000591790 5250 ntTSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
PTPRMP28827 PAPPA2-202ENST00000367662 9691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
PTPRMP28827 PTBP2-203ENST00000426398 3027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
PTPRMP28827 OR51Q1-201ENST00000300778 1096 ntAPPRIS P1 BASIC10.21□□□□□ -0.78
PTPRMP28827 OR51L1-201ENST00000321543 948 ntAPPRIS P1 BASIC10.21□□□□□ -0.78
PTPRMP28827 RNA5SP485-201ENST00000365053 119 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
PTPRMP28827 CD33-203ENST00000421133 1023 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
PTPRMP28827 AL512363.1-201ENST00000425089 586 ntTSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.78
PTPRMP28827 AC026391.1-201ENST00000450677 537 ntTSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.78
PTPRMP28827 AL138787.2-201ENST00000466576 367 ntTSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.78
PTPRMP28827 KDELR2-206ENST00000490996 655 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
PTPRMP28827 IGKV2-19-201ENST00000518132 283 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
PTPRMP28827 AP001208.1-201ENST00000518612 408 ntTSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.78
PTPRMP28827 AC009087.1-201ENST00000561827 369 ntTSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.78
PTPRMP28827 ZNF585A-205ENST00000588354 596 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
PTPRMP28827 ZNF561-AS1-207ENST00000591932 676 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
PTPRMP28827 AC008794.1-201ENST00000593063 560 ntTSL 4 BASIC10.21□□□□□ -0.78
PTPRMP28827 AL662797.2-201ENST00000607333 527 ntTSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.78
PTPRMP28827 Z98949.1-213ENST00000608921 856 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
PTPRMP28827 Metazoa_SRP.130-201ENST00000622625 267 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
PTPRMP28827 OR2L8-201ENST00000623922 939 ntAPPRIS P1 BASIC10.21□□□□□ -0.78
PTPRMP28827 OR51Q1-202ENST00000641085 1096 ntAPPRIS P1 BASIC10.21□□□□□ -0.78
PTPRMP28827 KANSL3-206ENST00000431828 5153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
PTPRMP28827 AC068775.1-202ENST00000538173 1602 ntAPPRIS P1 BASIC10.21□□□□□ -0.78
PTPRMP28827 INTS7-203ENST00000366994 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
PTPRMP28827 NEXN-202ENST00000334785 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
PTPRMP28827 PSMC1P4-201ENST00000515236 1327 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
PTPRMP28827 RBM27-201ENST00000265271 6451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
PTPRMP28827 SKIV2L2-201ENST00000230640 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
PTPRMP28827 AC123769.1-201ENST00000530992 3192 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
PTPRMP28827 ALDH2-201ENST00000261733 9569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
PTPRMP28827 SLC36A2-201ENST00000335244 3421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
PTPRMP28827 C1QTNF7-204ENST00000429690 4464 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC10.2□□□□□ -0.78
PTPRMP28827 ZNRD1ASP-211ENST00000376797 3270 ntTSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
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PTPRMP28827 AC027097.2-201ENST00000588925 1976 ntTSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
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PTPRMP28827 NELL2-217ENST00000551601 3148 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
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PTPRMP28827 DNAJC27-AS1-205ENST00000434897 4660 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
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PTPRMP28827 NUMB-229ENST00000557597 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
PTPRMP28827 MAP4-207ENST00000426837 8920 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
PTPRMP28827 MPZL3-201ENST00000278949 3968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
PTPRMP28827 NSD2-224ENST00000514045 3964 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
PTPRMP28827 ITGB3BP-201ENST00000271002 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
PTPRMP28827 OR14A2-201ENST00000366485 945 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
PTPRMP28827 BX284668.3-201ENST00000414128 882 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
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PTPRMP28827 GOLGA6L5P-203ENST00000559768 578 ntTSL 4 BASIC10.19□□□□□ -0.78
PTPRMP28827 AC006305.2-201ENST00000589617 552 ntTSL 4 BASIC10.19□□□□□ -0.78
PTPRMP28827 AC020915.3-201ENST00000595301 550 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
PTPRMP28827 GLUD1P2-202ENST00000630097 606 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
PTPRMP28827 DICER1-214ENST00000556045 2776 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
PTPRMP28827 MYO5A-213ENST00000613858 12139 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
PTPRMP28827 EPPK1-201ENST00000568225 15530 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
PTPRMP28827 CYP19A1-216ENST00000559878 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
PTPRMP28827 P2RY14-202ENST00000424796 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
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