Protein–RNA interactions for Protein: P24928

POLR2A, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,970 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2AP24928 LTA4H-209ENST00000552789 2025 ntTSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
POLR2AP24928 AL162511.1-201ENST00000556542 879 ntTSL 4 BASIC8.23□□□□□ -1.09
POLR2AP24928 AL161757.4-202ENST00000557467 737 ntTSL 3 BASIC8.23□□□□□ -1.09
POLR2AP24928 APOC2-205ENST00000592257 444 ntTSL 3 BASIC8.23□□□□□ -1.09
POLR2AP24928 Z99755.2-201ENST00000610215 364 ntTSL 3 BASIC8.23□□□□□ -1.09
POLR2AP24928 FKBP14-201ENST00000222803 4960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
POLR2AP24928 ZKSCAN5-201ENST00000326775 4178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
POLR2AP24928 PPP6C-201ENST00000373547 4118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
POLR2AP24928 CD101-201ENST00000256652 3283 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.23□□□□□ -1.09
POLR2AP24928 AKAP5-201ENST00000320636 2601 ntAPPRIS P1 BASIC8.23□□□□□ -1.09
POLR2AP24928 PRIM2-207ENST00000615550 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
POLR2AP24928 RUFY2-201ENST00000265865 2033 ntTSL 2 BASIC8.23□□□□□ -1.09
POLR2AP24928 ELMO1-202ENST00000396040 1982 ntTSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
POLR2AP24928 CDK15-201ENST00000260967 1635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
POLR2AP24928 KIAA1671-202ENST00000401395 6386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
POLR2AP24928 EPS15L1-214ENST00000602009 3915 ntTSL 2 BASIC8.22□□□□□ -1.09
POLR2AP24928 SYTL4-204ENST00000372989 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
POLR2AP24928 MAPK14-203ENST00000310795 1066 ntTSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
POLR2AP24928 UBBP5-201ENST00000446970 266 ntBASIC8.22□□□□□ -1.09
POLR2AP24928 AP002884.1-201ENST00000479691 655 ntBASIC8.22□□□□□ -1.09
POLR2AP24928 AC091874.2-201ENST00000505889 720 ntBASIC8.22□□□□□ -1.09
POLR2AP24928 UGT2A3P7-201ENST00000510485 734 ntBASIC8.22□□□□□ -1.09
POLR2AP24928 HSD3BP3-201ENST00000514706 994 ntBASIC8.22□□□□□ -1.09
POLR2AP24928 CCND2-AS2-201ENST00000537370 495 ntTSL 4 BASIC8.22□□□□□ -1.09
POLR2AP24928 LINC02413-201ENST00000549914 723 ntTSL 5 BASIC8.22□□□□□ -1.09
POLR2AP24928 AC015911.3-201ENST00000592908 849 ntTSL 5 BASIC8.22□□□□□ -1.09
POLR2AP24928 AC241377.2-201ENST00000612313 553 ntTSL 4 BASIC8.22□□□□□ -1.09
POLR2AP24928 AL035425.4-201ENST00000624509 1063 ntBASIC8.22□□□□□ -1.09
POLR2AP24928 OR2AK2-202ENST00000641852 1008 ntAPPRIS P2 BASIC8.22□□□□□ -1.09
POLR2AP24928 CYP39A1-205ENST00000619708 2269 ntTSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
POLR2AP24928 PARP9-202ENST00000462315 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
POLR2AP24928 WDR87-201ENST00000303868 8847 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC8.22□□□□□ -1.09
POLR2AP24928 PEG10-208ENST00000615790 6394 ntTSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
POLR2AP24928 TCF4-246ENST00000570287 3163 ntTSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
POLR2AP24928 DYNC2LI1-203ENST00000398823 2903 ntTSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
POLR2AP24928 BDNF-206ENST00000395983 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
POLR2AP24928 LSAMP-205ENST00000490035 9446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
POLR2AP24928 AMY2A-204ENST00000622339 1862 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.22□□□□□ -1.09
POLR2AP24928 TCP11X2-202ENST00000453326 1747 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.22□□□□□ -1.09
POLR2AP24928 TCP11X1-201ENST00000597070 1747 ntTSL 2 BASIC8.22□□□□□ -1.09
POLR2AP24928 BMX-203ENST00000357607 2598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.22□□□□□ -1.09
POLR2AP24928 SCARB2-211ENST00000638603 4284 ntTSL 5 BASIC8.22□□□□□ -1.09
POLR2AP24928 RASSF6-201ENST00000307439 5994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
POLR2AP24928 MAPK10-380ENST00000642015 3137 ntAPPRIS P2 BASIC8.22□□□□□ -1.09
POLR2AP24928 AL358913.2-201ENST00000553881 1548 ntBASIC8.22□□□□□ -1.09
POLR2AP24928 ZNF189-202ENST00000339664 3021 ntTSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
POLR2AP24928 LINC01204-203ENST00000609127 2900 ntTSL 2 BASIC8.22□□□□□ -1.09
POLR2AP24928 ACOD1-201ENST00000377462 2165 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.22□□□□□ -1.09
POLR2AP24928 AC011632.1-202ENST00000518128 2810 ntTSL 2 BASIC8.22□□□□□ -1.09
POLR2AP24928 WDR75-201ENST00000314761 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
POLR2AP24928 YWHAZP6-201ENST00000399764 738 ntBASIC8.22□□□□□ -1.09
POLR2AP24928 LINC00437-201ENST00000414161 791 ntTSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
POLR2AP24928 RPS7P12-201ENST00000422385 582 ntBASIC8.22□□□□□ -1.09
POLR2AP24928 COL11A2P1-205ENST00000441798 676 ntBASIC8.22□□□□□ -1.09
POLR2AP24928 AC084754.1-201ENST00000463466 464 ntBASIC8.22□□□□□ -1.09
POLR2AP24928 RN7SL88P-201ENST00000480166 299 ntBASIC8.22□□□□□ -1.09
POLR2AP24928 AC079921.2-201ENST00000507579 455 ntTSL 3 BASIC8.22□□□□□ -1.09
POLR2AP24928 AC008906.1-201ENST00000512856 993 ntTSL 5 BASIC8.22□□□□□ -1.09
POLR2AP24928 AC022558.1-201ENST00000560450 454 ntTSL 3 BASIC8.22□□□□□ -1.09
POLR2AP24928 RN7SL230P-201ENST00000580835 303 ntBASIC8.22□□□□□ -1.09
POLR2AP24928 LINC02028-206ENST00000593326 810 ntTSL 5 BASIC8.22□□□□□ -1.09
POLR2AP24928 AP001052.1-201ENST00000626421 99 ntBASIC8.22□□□□□ -1.09
POLR2AP24928 LINC01141-204ENST00000635564 1008 ntTSL 5 BASIC8.22□□□□□ -1.09
POLR2AP24928 MAP4K4-203ENST00000347699 3792 ntTSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
POLR2AP24928 SLFN11-202ENST00000394566 5030 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.22□□□□□ -1.09
POLR2AP24928 C2CD3-202ENST00000334126 7960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.22□□□□□ -1.09
POLR2AP24928 FAM135A-207ENST00000457062 5282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
POLR2AP24928 LINC01579-207ENST00000557481 3480 ntTSL 5 BASIC8.22□□□□□ -1.09
POLR2AP24928 PKN2-202ENST00000370513 2890 ntTSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
POLR2AP24928 DLG2-229ENST00000531015 2892 ntTSL 2 BASIC8.22□□□□□ -1.09
POLR2AP24928 ERG-206ENST00000398911 4914 ntTSL 5 BASIC8.22□□□□□ -1.09
POLR2AP24928 SALL1P1-201ENST00000438101 3837 ntBASIC8.22□□□□□ -1.09
POLR2AP24928 STK32B-207ENST00000512636 3272 ntTSL 5 BASIC8.22□□□□□ -1.09
POLR2AP24928 ABLIM3-201ENST00000309868 4326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
POLR2AP24928 FYB1-210ENST00000515010 2578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
POLR2AP24928 SETD5-204ENST00000406341 6582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.21□□□□□ -1.09
POLR2AP24928 AC091806.1-201ENST00000452690 3000 ntTSL 2 BASIC8.21□□□□□ -1.09
POLR2AP24928 LY75-CD302-202ENST00000505052 5482 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.21□□□□□ -1.09
POLR2AP24928 TXLNG-201ENST00000380122 4401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.21□□□□□ -1.09
POLR2AP24928 ZNF778-207ENST00000620195 11031 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC8.21□□□□□ -1.09
POLR2AP24928 ADGRE1-203ENST00000381404 3056 ntTSL 2 BASIC8.21□□□□□ -1.09
POLR2AP24928 RPS29-201ENST00000245458 296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.21□□□□□ -1.09
POLR2AP24928 CLEC4A-202ENST00000345999 841 ntTSL 5 BASIC8.21□□□□□ -1.09
POLR2AP24928 AC068888.2-201ENST00000435621 536 ntTSL 3 BASIC8.21□□□□□ -1.09
POLR2AP24928 LIX1L-AS1-206ENST00000447686 846 ntTSL 2 BASIC8.21□□□□□ -1.09
POLR2AP24928 DPP10-AS1-202ENST00000448663 644 ntTSL 3 BASIC8.21□□□□□ -1.09
POLR2AP24928 PTTG2-201ENST00000504686 691 ntAPPRIS P1 BASIC8.21□□□□□ -1.09
POLR2AP24928 AC084125.1-201ENST00000525461 429 ntTSL 3 BASIC8.21□□□□□ -1.09
POLR2AP24928 AC145285.4-201ENST00000568183 540 ntTSL 3 BASIC8.21□□□□□ -1.09
POLR2AP24928 AC023421.2-202ENST00000586213 547 ntTSL 3 BASIC8.21□□□□□ -1.09
POLR2AP24928 Metazoa_SRP.129-201ENST00000619776 251 ntBASIC8.21□□□□□ -1.09
POLR2AP24928 AL049767.1-201ENST00000636811 514 ntTSL 5 BASIC8.21□□□□□ -1.09
POLR2AP24928 CD160-205ENST00000616463 3388 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.21□□□□□ -1.09
POLR2AP24928 RBPJ-214ENST00000507561 1689 ntTSL 1 (best) BASIC8.21□□□□□ -1.09
POLR2AP24928 ZNF791-201ENST00000343325 4554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.21□□□□□ -1.09
POLR2AP24928 MYOCD-201ENST00000343344 2817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.21□□□□□ -1.1
POLR2AP24928 SLC1A2-201ENST00000278379 11696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.21□□□□□ -1.1
POLR2AP24928 TYW1B-203ENST00000620995 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.21□□□□□ -1.1
POLR2AP24928 FAM107A-202ENST00000394481 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.21□□□□□ -1.1
POLR2AP24928 MT-CO1-201ENST00000361624 1542 ntAPPRIS P1 BASIC8.21□□□□□ -1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 99.1 ms