Protein–RNA interactions for Protein: P28827

PTPRM, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, humanhuman

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Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRMP28827 MYH2-202ENST00000397183 6078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
PTPRMP28827 SMIM2-201ENST00000400419 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
PTPRMP28827 AL137220.1-201ENST00000431369 661 ntTSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
PTPRMP28827 GTF2A1-202ENST00000434192 1199 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
PTPRMP28827 AC007283.1-201ENST00000434645 445 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
PTPRMP28827 NPM1P51-201ENST00000443470 744 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
PTPRMP28827 EAF2-202ENST00000451944 960 ntTSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
PTPRMP28827 RPL5P11-201ENST00000498068 893 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
PTPRMP28827 AC008443.6-204ENST00000511517 738 ntTSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
PTPRMP28827 AC079866.1-201ENST00000534985 1220 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
PTPRMP28827 LINC02457-201ENST00000552992 596 ntTSL 4 BASIC10.29□□□□□ -0.76
PTPRMP28827 MRPS5P4-201ENST00000592830 325 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
PTPRMP28827 IGKV2OR2-1-201ENST00000605129 304 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
PTPRMP28827 AC069234.4-201ENST00000621276 412 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
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PTPRMP28827 TRPM8-204ENST00000433712 5291 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
PTPRMP28827 LINC01140-201ENST00000461990 3181 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
PTPRMP28827 ZNF471-201ENST00000308031 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
PTPRMP28827 COA1-203ENST00000395879 2448 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
PTPRMP28827 NUDT13-202ENST00000357321 2102 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
PTPRMP28827 SPIN3-211ENST00000638712 4286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
PTPRMP28827 FBXW10-201ENST00000301938 3221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
PTPRMP28827 DOCK3-201ENST00000266037 8755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
PTPRMP28827 IMPG1-201ENST00000369950 3558 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
PTPRMP28827 TDGF1P3-202ENST00000602699 2710 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
PTPRMP28827 SEC16A-205ENST00000371706 8093 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
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PTPRMP28827 GIGYF2-203ENST00000409451 5937 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
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PTPRMP28827 SLC24A4-205ENST00000532405 9950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
PTPRMP28827 TPD52-213ENST00000520527 2638 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
PTPRMP28827 DEFA6-201ENST00000297436 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
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PTPRMP28827 AL365356.3-201ENST00000427341 657 ntTSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
PTPRMP28827 AC007365.1-201ENST00000439964 627 ntTSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
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PTPRMP28827 MDFIC2-201ENST00000567252 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
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PTPRMP28827 AIM2-202ENST00000368130 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
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PTPRMP28827 C4orf26-201ENST00000311623 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
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PTPRMP28827 LINC01141-204ENST00000635564 1008 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
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PTPRMP28827 SOHLH2-202ENST00000379881 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
PTPRMP28827 DDX21-201ENST00000354185 4711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
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PTPRMP28827 CTC1-201ENST00000315684 7021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
PTPRMP28827 ATP5E-201ENST00000243997 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
PTPRMP28827 SRBD1-201ENST00000263736 3681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
PTPRMP28827 AC138207.6-201ENST00000579164 1967 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
PTPRMP28827 SEMA3C-203ENST00000419255 2415 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
PTPRMP28827 ZNF2-204ENST00000617923 3885 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
PTPRMP28827 TBCCD1-203ENST00000424280 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
PTPRMP28827 AKAP12-203ENST00000359755 6190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
PTPRMP28827 MT4-201ENST00000219162 294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
PTPRMP28827 SCGB3A2-201ENST00000296694 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
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