Protein–RNA interactions for Protein: H3BUS1

SYS1-DBNDD2, SYS1-DBNDD2 readthrough (NMD candidate), humanhuman

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Length 97 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYS1-DBNDD2H3BUS1 C9orf92-202ENST00000380685 379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RNU11-201ENST00000387069 134 ntBASIC5□□□□□ -1.61
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RPL23A-203ENST00000394938 688 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL360271.1-201ENST00000395679 510 ntBASIC5□□□□□ -1.61
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL031282.1-204ENST00000418950 497 ntBASIC5□□□□□ -1.61
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL355516.1-201ENST00000422082 746 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
SYS1-DBNDD2H3BUS1 OR1M1-201ENST00000429566 1035 ntAPPRIS P1 BASIC5□□□□□ -1.61
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL032821.1-201ENST00000430895 581 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL590399.4-201ENST00000436561 601 ntBASIC5□□□□□ -1.61
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LINC00460-203ENST00000444865 739 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LIN28AP2-201ENST00000445283 458 ntBASIC5□□□□□ -1.61
SYS1-DBNDD2H3BUS1 EIPR1-IT1-201ENST00000454977 718 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL590490.1-201ENST00000455599 316 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AZI2-207ENST00000457172 1136 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RN7SL607P-201ENST00000461220 299 ntBASIC5□□□□□ -1.61
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC015820.1-201ENST00000473882 321 ntBASIC5□□□□□ -1.61
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC008638.2-201ENST00000503840 715 ntBASIC5□□□□□ -1.61
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GSTO3P-201ENST00000504733 718 ntBASIC5□□□□□ -1.61
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ARHGAP22-IT1-201ENST00000505718 470 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SNX18P27-201ENST00000523611 779 ntBASIC5□□□□□ -1.61
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC078927.1-201ENST00000539652 984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ANAPC15-211ENST00000542531 812 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC117498.1-201ENST00000548742 713 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GSTZ1-216ENST00000556627 919 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC018563.1-201ENST00000558089 566 ntTSL 4 BASIC5□□□□□ -1.61
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC023908.2-201ENST00000558616 318 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
SYS1-DBNDD2H3BUS1 USP2-AS1-205ENST00000578923 895 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC093484.4-201ENST00000583934 461 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC087645.1-201ENST00000588528 291 ntBASIC5□□□□□ -1.61
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AP005131.4-202ENST00000590468 570 ntTSL 4 BASIC5□□□□□ -1.61
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL445223.1-201ENST00000595998 1051 ntBASIC5□□□□□ -1.61
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC010618.2-201ENST00000596192 460 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DARS-AS1-213ENST00000596410 741 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZNF611-214ENST00000600943 560 ntTSL 4 BASIC5□□□□□ -1.61
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL360012.1-201ENST00000602813 131 ntBASIC5□□□□□ -1.61
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC011894.1-201ENST00000603255 456 ntBASIC5□□□□□ -1.61
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ST7-OT4_3.1-201ENST00000615542 293 ntBASIC5□□□□□ -1.61
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CU633967.1-202ENST00000623449 560 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CU638689.5-201ENST00000623892 1032 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LINC01320-209ENST00000625995 928 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RIC3-202ENST00000335425 5223 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ADGRF1-203ENST00000371253 5468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZNF329-204ENST00000598312 3410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MTA3-201ENST00000405094 1785 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RNF150-202ENST00000420921 3673 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PMFBP1-207ENST00000537465 3935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TRPC4-210ENST00000625583 3009 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CLMN-201ENST00000298912 12747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ANKS1B-207ENST00000546960 1383 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SYT14-207ENST00000629778 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
SYS1-DBNDD2H3BUS1 OR51I2-202ENST00000641930 3302 ntAPPRIS P1 BASIC5□□□□□ -1.61
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GLRA3-202ENST00000340217 3065 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ATP13A4-204ENST00000400270 1458 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC089998.1-201ENST00000548575 3141 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SNTN-203ENST00000496807 3746 ntTSL 4 BASIC4.99□□□□□ -1.61
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TMEM200A-202ENST00000392429 5017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NUMB-203ENST00000359560 3309 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC007848.1-201ENST00000538430 1405 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FGFR2-218ENST00000478859 3990 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MYL12A-201ENST00000217652 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL078621.1-201ENST00000272567 768 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
SYS1-DBNDD2H3BUS1 OR4M1-201ENST00000315957 1116 ntAPPRIS P1 BASIC4.99□□□□□ -1.61
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RNU1-59P-201ENST00000364829 162 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RPSAP42-201ENST00000403415 878 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL590617.1-201ENST00000405630 748 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RPS17P17-201ENST00000419392 409 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
SYS1-DBNDD2H3BUS1 EEF1GP7-201ENST00000422983 703 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TYROBP-202ENST00000424586 541 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MED15P9-201ENST00000424716 533 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KATNBL1P2-201ENST00000433311 835 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LINC01805-201ENST00000436433 572 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC105942.1-202ENST00000438509 952 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LINC01803-201ENST00000438659 613 ntTSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL445465.1-204ENST00000440220 447 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC110994.1-201ENST00000468519 406 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RN7SL573P-201ENST00000485340 276 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RN7SL561P-201ENST00000488553 281 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AP005202.1-201ENST00000489915 867 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PGAM4P2-201ENST00000512491 721 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC144568.2-201ENST00000522481 944 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC025524.2-202ENST00000523042 535 ntTSL 4 BASIC4.99□□□□□ -1.61
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC107959.3-202ENST00000523806 450 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AF235103.1-201ENST00000530223 439 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC090692.1-201ENST00000531569 541 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC090673.2-201ENST00000544279 454 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NOVA1-AS1-201ENST00000547786 818 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PSMA3-AS1-210ENST00000556002 1039 ntTSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SLC25A3P1-203ENST00000563752 460 ntTSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
SYS1-DBNDD2H3BUS1 Metazoa_SRP.57-201ENST00000597717 283 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LINC00635-210ENST00000600240 714 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ANKRD20A19P-203ENST00000602724 295 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL953862.2-201ENST00000603089 820 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC097467.4-201ENST00000605504 141 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC104184.1-201ENST00000607513 721 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZSCAN26-203ENST00000611552 1030 ntTSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
SYS1-DBNDD2H3BUS1 5S_rRNA.20-201ENST00000612104 118 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC123788.2-201ENST00000612290 283 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
SYS1-DBNDD2H3BUS1 IGKV2D-29-202ENST00000612356 310 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
SYS1-DBNDD2H3BUS1 U1.25-201ENST00000614085 162 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
SYS1-DBNDD2H3BUS1 U1.34-201ENST00000618578 162 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
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