Protein–RNA interactions for Protein: Q1MSJ5

CSPP1, Centrosome and spindle pole-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSPP1Q1MSJ5 RPS3AP37-201ENST00000419176 745 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
CSPP1Q1MSJ5 AL589946.1-201ENST00000421465 420 ntTSL 3 BASIC9.82□□□□□ -0.84
CSPP1Q1MSJ5 AL390962.1-201ENST00000421507 526 ntTSL 3 BASIC9.82□□□□□ -0.84
CSPP1Q1MSJ5 AC009988.1-201ENST00000434988 310 ntTSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
CSPP1Q1MSJ5 BBIP1-205ENST00000436562 383 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.82□□□□□ -0.84
CSPP1Q1MSJ5 AL359636.3-201ENST00000439471 301 ntTSL 2 BASIC9.82□□□□□ -0.84
CSPP1Q1MSJ5 RPL15P1-201ENST00000439981 600 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
CSPP1Q1MSJ5 AC024084.1-201ENST00000440744 455 ntTSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
CSPP1Q1MSJ5 RPL34P26-201ENST00000445636 354 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
CSPP1Q1MSJ5 AC104843.1-201ENST00000451203 319 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
CSPP1Q1MSJ5 AL161937.1-202ENST00000451960 341 ntTSL 3 BASIC9.82□□□□□ -0.84
CSPP1Q1MSJ5 DAP3P2-201ENST00000458547 510 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
CSPP1Q1MSJ5 AC110994.1-201ENST00000468519 406 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
CSPP1Q1MSJ5 RPS10P16-201ENST00000483812 496 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
CSPP1Q1MSJ5 AC079921.2-201ENST00000507579 455 ntTSL 3 BASIC9.82□□□□□ -0.84
CSPP1Q1MSJ5 OR10J2P-201ENST00000514684 961 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
CSPP1Q1MSJ5 AP002957.1-201ENST00000525952 406 ntTSL 3 BASIC9.82□□□□□ -0.84
CSPP1Q1MSJ5 AP005436.3-201ENST00000532849 572 ntTSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
CSPP1Q1MSJ5 AC138466.2-201ENST00000540993 304 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
CSPP1Q1MSJ5 RPL41-204ENST00000546591 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
CSPP1Q1MSJ5 AC007375.2-201ENST00000557752 603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
CSPP1Q1MSJ5 PSMA4-206ENST00000558341 719 ntTSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
CSPP1Q1MSJ5 AC135628.1-201ENST00000568867 534 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
CSPP1Q1MSJ5 AC005771.1-201ENST00000585581 349 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
CSPP1Q1MSJ5 HMGN2P46-208ENST00000598619 490 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
CSPP1Q1MSJ5 AL357078.3-201ENST00000607528 618 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
CSPP1Q1MSJ5 AL354976.1-201ENST00000613843 387 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
CSPP1Q1MSJ5 RFPL3-AS1_1.1-201ENST00000617561 88 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
CSPP1Q1MSJ5 AC091953.4-201ENST00000625179 341 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
CSPP1Q1MSJ5 UGP2-231ENST00000627474 264 ntTSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
CSPP1Q1MSJ5 FAM238C-205ENST00000640641 391 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
CSPP1Q1MSJ5 GLRX-202ENST00000379979 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
CSPP1Q1MSJ5 TRIM77-201ENST00000398290 1353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
CSPP1Q1MSJ5 RBMS1-204ENST00000409289 1490 ntTSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
CSPP1Q1MSJ5 LINC02476-201ENST00000426413 1577 ntTSL 2 BASIC9.82□□□□□ -0.84
CSPP1Q1MSJ5 CPEB4-209ENST00000522336 1551 ntTSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
CSPP1Q1MSJ5 PPWD1-215ENST00000538977 2055 ntTSL 2 BASIC9.82□□□□□ -0.84
CSPP1Q1MSJ5 SLC16A4-210ENST00000541986 2496 ntTSL 2 BASIC9.82□□□□□ -0.84
CSPP1Q1MSJ5 C2CD5-218ENST00000545552 3471 ntTSL 2 BASIC9.82□□□□□ -0.84
CSPP1Q1MSJ5 OPALIN-204ENST00000419479 3581 ntTSL 2 BASIC9.82□□□□□ -0.84
CSPP1Q1MSJ5 PTPDC1-204ENST00000620992 4437 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.82□□□□□ -0.84
CSPP1Q1MSJ5 STXBP5-AS1-209ENST00000606831 2025 ntTSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
CSPP1Q1MSJ5 LRBA-204ENST00000507224 8826 ntTSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
CSPP1Q1MSJ5 CABLES1-202ENST00000400473 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.82□□□□□ -0.84
CSPP1Q1MSJ5 WDR92-202ENST00000406245 1401 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
CSPP1Q1MSJ5 AC018880.1-201ENST00000418898 1319 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
CSPP1Q1MSJ5 PSMC1P3-201ENST00000453822 1318 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
CSPP1Q1MSJ5 MUC21-201ENST00000376296 3651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
CSPP1Q1MSJ5 FLJ21408-201ENST00000499939 2594 ntTSL 2 BASIC9.81□□□□□ -0.84
CSPP1Q1MSJ5 BDNF-213ENST00000525950 3829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
CSPP1Q1MSJ5 CU633906.2-201ENST00000624576 2257 ntTSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
CSPP1Q1MSJ5 CD46-203ENST00000354848 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
CSPP1Q1MSJ5 HNRNPA1P54-201ENST00000411857 9714 ntBASIC9.81□□□□□ -0.84
CSPP1Q1MSJ5 ZNF679-202ENST00000421025 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
CSPP1Q1MSJ5 TTC23-202ENST00000394129 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.81□□□□□ -0.84
CSPP1Q1MSJ5 OR4S2-201ENST00000312422 936 ntAPPRIS P1 BASIC9.81□□□□□ -0.84
CSPP1Q1MSJ5 Metazoa_SRP.5-201ENST00000356560 281 ntBASIC9.81□□□□□ -0.84
CSPP1Q1MSJ5 ZDHHC11B-201ENST00000382776 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
CSPP1Q1MSJ5 VDAC1P8-201ENST00000406025 853 ntBASIC9.81□□□□□ -0.84
CSPP1Q1MSJ5 RN7SKP154-201ENST00000410136 290 ntBASIC9.81□□□□□ -0.84
CSPP1Q1MSJ5 AL136380.2-201ENST00000411837 492 ntBASIC9.81□□□□□ -0.84
CSPP1Q1MSJ5 RPL30P16-201ENST00000419341 429 ntBASIC9.81□□□□□ -0.84
CSPP1Q1MSJ5 AL360091.3-201ENST00000442146 387 ntTSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
CSPP1Q1MSJ5 AL133215.1-201ENST00000447344 342 ntTSL 3 BASIC9.81□□□□□ -0.84
CSPP1Q1MSJ5 AL589880.1-201ENST00000448271 287 ntBASIC9.81□□□□□ -0.84
CSPP1Q1MSJ5 TMEM246-AS1-204ENST00000450109 538 ntTSL 3 BASIC9.81□□□□□ -0.84
CSPP1Q1MSJ5 RN7SL554P-201ENST00000468197 292 ntBASIC9.81□□□□□ -0.84
CSPP1Q1MSJ5 AC055758.2-202ENST00000482351 624 ntTSL 2 BASIC9.81□□□□□ -0.84
CSPP1Q1MSJ5 AC108748.1-201ENST00000487772 515 ntTSL 3 BASIC9.81□□□□□ -0.84
CSPP1Q1MSJ5 AC073848.1-201ENST00000514339 457 ntTSL 3 BASIC9.81□□□□□ -0.84
CSPP1Q1MSJ5 AC138866.1-201ENST00000514522 497 ntBASIC9.81□□□□□ -0.84
CSPP1Q1MSJ5 CHCHD7-205ENST00000517933 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC9.81□□□□□ -0.84
CSPP1Q1MSJ5 AC103409.1-202ENST00000518416 577 ntTSL 4 BASIC9.81□□□□□ -0.84
CSPP1Q1MSJ5 BTF3P1-201ENST00000522014 495 ntBASIC9.81□□□□□ -0.84
CSPP1Q1MSJ5 CHCHD7-215ENST00000523061 557 ntTSL 3 BASIC9.81□□□□□ -0.84
CSPP1Q1MSJ5 HNRNPA1P38-201ENST00000523612 957 ntBASIC9.81□□□□□ -0.84
CSPP1Q1MSJ5 AC104261.1-202ENST00000557946 509 ntTSL 3 BASIC9.81□□□□□ -0.84
CSPP1Q1MSJ5 AC025918.2-201ENST00000558683 763 ntBASIC9.81□□□□□ -0.84
CSPP1Q1MSJ5 AC104261.1-201ENST00000560203 392 ntTSL 3 BASIC9.81□□□□□ -0.84
CSPP1Q1MSJ5 AC137800.1-202ENST00000562098 446 ntBASIC9.81□□□□□ -0.84
CSPP1Q1MSJ5 HMGN2P46-207ENST00000568669 388 ntTSL 3 BASIC9.81□□□□□ -0.84
CSPP1Q1MSJ5 RBM22P13-201ENST00000569805 1244 ntBASIC9.81□□□□□ -0.84
CSPP1Q1MSJ5 AC011840.3-201ENST00000579378 280 ntTSL 3 BASIC9.81□□□□□ -0.84
CSPP1Q1MSJ5 AC016382.1-201ENST00000583580 387 ntTSL 3 BASIC9.81□□□□□ -0.84
CSPP1Q1MSJ5 TTN-AS1-213ENST00000584485 838 ntTSL 3 BASIC9.81□□□□□ -0.84
CSPP1Q1MSJ5 AC008734.2-201ENST00000595277 477 ntBASIC9.81□□□□□ -0.84
CSPP1Q1MSJ5 CLECL1-204ENST00000621400 611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
CSPP1Q1MSJ5 AL359740.1-201ENST00000624340 592 ntBASIC9.81□□□□□ -0.84
CSPP1Q1MSJ5 SATB1-AS1-263ENST00000630022 622 ntTSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
CSPP1Q1MSJ5 CRNDE-214ENST00000637011 865 ntTSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
CSPP1Q1MSJ5 AC092329.4-205ENST00000638822 574 ntTSL 3 BASIC9.81□□□□□ -0.84
CSPP1Q1MSJ5 AC099654.13-201ENST00000639774 207 ntBASIC9.81□□□□□ -0.84
CSPP1Q1MSJ5 OR7E91P-202ENST00000642062 1198 ntBASIC9.81□□□□□ -0.84
CSPP1Q1MSJ5 OR4Q2-201ENST00000541415 2778 ntAPPRIS P5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
CSPP1Q1MSJ5 RPS17-209ENST00000561157 1909 ntTSL 2 BASIC9.81□□□□□ -0.84
CSPP1Q1MSJ5 CDH12-202ENST00000504376 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
CSPP1Q1MSJ5 KCNMA1-214ENST00000434208 4055 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
CSPP1Q1MSJ5 AC016027.2-201ENST00000441167 2493 ntTSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
CSPP1Q1MSJ5 ABLIM3-201ENST00000309868 4326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
CSPP1Q1MSJ5 BCAT1-202ENST00000342945 4319 ntTSL 2 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.7 ms