Protein–RNA interactions for Protein: H3BUS1

SYS1-DBNDD2, SYS1-DBNDD2 readthrough (NMD candidate), humanhuman

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Length 97 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CACNB4-245ENST00000637284 2423 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LINC02388-201ENST00000550678 1975 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LINC01492-201ENST00000411575 3738 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AF064860.2-201ENST00000457325 1542 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MYCBP2-212ENST00000612956 1542 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CLEC4E-201ENST00000299663 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC244100.3-202ENST00000617328 1721 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZNF268-205ENST00000536435 13475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 C2orf80-201ENST00000341287 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FAM32BP-201ENST00000344033 333 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RN7SKP237-201ENST00000364663 301 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TRBV25-1-202ENST00000390398 381 ntAPPRIS P1 BASIC5.04□□□□□ -1.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RNU6-1055P-201ENST00000391085 107 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RPL9P21-201ENST00000392269 505 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CAV2-203ENST00000393480 1179 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RN7SKP188-201ENST00000410789 317 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RNA5SP265-201ENST00000411023 111 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC007422.2-201ENST00000419809 167 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL353148.1-202ENST00000424701 551 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC021876.1-201ENST00000425959 359 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL023653.1-201ENST00000432513 326 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AJ006995.1-201ENST00000433344 572 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC083822.1-201ENST00000438001 201 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC092295.1-201ENST00000446262 434 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GPR141-202ENST00000447769 1270 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL356310.1-201ENST00000452024 585 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SEPHS1P7-201ENST00000452995 1177 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 Z82173.1-201ENST00000453924 484 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PSPC1P2-201ENST00000455130 225 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MKNK1-207ENST00000465783 464 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RN7SL233P-201ENST00000469988 277 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RPL12P42-201ENST00000481802 499 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RPL17P37-201ENST00000490729 548 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC098583.2-201ENST00000504151 372 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MRPL57P6-201ENST00000506570 309 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SDHC-208ENST00000513009 369 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ADAM20P2-201ENST00000515830 1273 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KLF3P1-201ENST00000521506 1022 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC109466.1-203ENST00000524297 1083 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 WT1-AS-206ENST00000525436 1254 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AP000893.2-201ENST00000527550 433 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 VEPH1-219ENST00000537559 992 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC073651.1-201ENST00000544015 465 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC024224.2-201ENST00000544225 782 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TGFB3-AS1-201ENST00000553732 580 ntTSL 4 BASIC5.04□□□□□ -1.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FAM174B-204ENST00000555064 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC5.04□□□□□ -1.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CRTC3-AS1-201ENST00000558105 502 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC007494.2-201ENST00000563757 764 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC083837.1-201ENST00000565297 2994 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TTN-AS1-210ENST00000578746 677 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC090371.1-201ENST00000580071 558 ntTSL 4 BASIC5.04□□□□□ -1.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MIR3159-201ENST00000584572 74 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC012301.1-201ENST00000586391 581 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TSPAN16-205ENST00000592955 927 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MARK3P1-201ENST00000604796 643 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC020728.1-201ENST00000605749 1216 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TPTE2P2-202ENST00000605924 2113 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC063962.1-201ENST00000608199 521 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TCL6_3.1-201ENST00000619064 137 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 Metazoa_SRP.176-201ENST00000619772 282 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 Metazoa_SRP.62-201ENST00000619972 268 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LINC01646-202ENST00000634256 1107 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LNX2-201ENST00000316334 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 WDR64-201ENST00000366552 4371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LINC02086-202ENST00000492522 2091 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DNAH3-201ENST00000261383 12394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SETX-201ENST00000224140 11100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SCARB2-207ENST00000638295 4507 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SCN1A-203ENST00000409050 5946 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RGSL1-201ENST00000294854 3696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SYTL2-228ENST00000533892 1441 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PLCE1-AS2-202ENST00000432782 1612 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RBM26-AS1-202ENST00000606049 2427 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SLC16A4-201ENST00000369779 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GABRA2-206ENST00000507460 5812 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 OR52N5-202ENST00000641181 2778 ntAPPRIS P1 BASIC5.04□□□□□ -1.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 OR5B2-202ENST00000641342 2184 ntAPPRIS P1 BASIC5.04□□□□□ -1.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TBC1D5-201ENST00000253692 7854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NACAP1-201ENST00000419462 1555 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CDH13-209ENST00000567109 8042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC007998.4-201ENST00000612496 2533 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RAD17-201ENST00000282891 2135 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LINC01602-201ENST00000522992 2109 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CIR1-201ENST00000342016 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LINC01991-202ENST00000446091 1524 ntTSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL358913.2-201ENST00000553881 1548 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC127164.1-201ENST00000548738 4196 ntTSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 IPO8-209ENST00000544829 3212 ntTSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TRAF5-201ENST00000261464 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 OR52B5P-203ENST00000641694 1313 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GLYATL1-201ENST00000300079 2068 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ARHGEF12-213ENST00000532993 8753 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZEB2-244ENST00000638007 9140 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SLC4A4-202ENST00000340595 7640 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CASC20-201ENST00000415932 1484 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CDH13-210ENST00000567445 1456 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ENTPD1-AS1-202ENST00000416301 4241 ntTSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZNF300P1-201ENST00000356555 1822 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 OR2G2-201ENST00000320065 954 ntAPPRIS P1 BASIC5.03□□□□□ -1.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TRAV8-3-201ENST00000390435 341 ntAPPRIS P1 BASIC5.03□□□□□ -1.6
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