Protein–RNA interactions for Protein: Q15116

PDCD1, Programmed cell death protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD1Q15116 FGF9-201ENST00000382353 4220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
PDCD1Q15116 PDE4DIP-206ENST00000369356 8307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
PDCD1Q15116 FKBP15-201ENST00000238256 4336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
PDCD1Q15116 AC025428.2-201ENST00000435367 2672 ntTSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
PDCD1Q15116 AL132656.3-201ENST00000606384 1595 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
PDCD1Q15116 DNAI1-201ENST00000242317 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
PDCD1Q15116 GIMAP2-201ENST00000223293 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
PDCD1Q15116 TMEM68-219ENST00000617977 4512 ntTSL 5 BASIC6.79□□□□□ -1.32
PDCD1Q15116 ZNF680-201ENST00000309683 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
PDCD1Q15116 DEFB124-201ENST00000317676 216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
PDCD1Q15116 PTTG1-201ENST00000352433 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
PDCD1Q15116 RNA5SP426-201ENST00000362901 121 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
PDCD1Q15116 RNU4-59P-201ENST00000364447 116 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
PDCD1Q15116 TRAPPC3L-202ENST00000368602 1113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.79□□□□□ -1.32
PDCD1Q15116 SMARCA2-205ENST00000382183 1178 ntTSL 5 BASIC6.79□□□□□ -1.32
PDCD1Q15116 ZNF816-ZNF321P-201ENST00000391777 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.79□□□□□ -1.32
PDCD1Q15116 TAF9BP2-201ENST00000400856 499 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
PDCD1Q15116 AC004009.1-201ENST00000412413 567 ntTSL 5 BASIC6.79□□□□□ -1.32
PDCD1Q15116 AL158050.1-201ENST00000416077 457 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
PDCD1Q15116 AC008155.1-201ENST00000421078 329 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
PDCD1Q15116 MTCO2P23-201ENST00000425216 680 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
PDCD1Q15116 AL357832.1-201ENST00000427460 420 ntTSL 3 BASIC6.79□□□□□ -1.32
PDCD1Q15116 RPL21P88-201ENST00000436649 436 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
PDCD1Q15116 AP002856.4-201ENST00000441638 569 ntTSL 4 BASIC6.79□□□□□ -1.32
PDCD1Q15116 LINC01376-204ENST00000449124 626 ntTSL 2 BASIC6.79□□□□□ -1.32
PDCD1Q15116 LINC01432-201ENST00000449427 677 ntTSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
PDCD1Q15116 LINC01961-201ENST00000449954 745 ntTSL 5 BASIC6.79□□□□□ -1.32
PDCD1Q15116 RPL7P55-201ENST00000450522 746 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
PDCD1Q15116 FGF12-206ENST00000450716 768 ntTSL 5 BASIC6.79□□□□□ -1.32
PDCD1Q15116 RPL7P61-201ENST00000451721 751 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
PDCD1Q15116 LINC01888-202ENST00000457602 574 ntTSL 2 BASIC6.79□□□□□ -1.32
PDCD1Q15116 PTP4A2-201ENST00000457805 1032 ntTSL 2 BASIC6.79□□□□□ -1.32
PDCD1Q15116 RPSAP37-201ENST00000470913 821 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
PDCD1Q15116 TMEM196-205ENST00000493519 687 ntTSL 5 BASIC6.79□□□□□ -1.32
PDCD1Q15116 AC124893.1-201ENST00000496247 545 ntTSL 5 BASIC6.79□□□□□ -1.32
PDCD1Q15116 LINC02201-201ENST00000508992 468 ntTSL 2 BASIC6.79□□□□□ -1.32
PDCD1Q15116 NR1I3-229ENST00000511748 480 ntTSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
PDCD1Q15116 AC104123.1-203ENST00000513158 575 ntTSL 3 BASIC6.79□□□□□ -1.32
PDCD1Q15116 Y_RNA.717-201ENST00000517106 92 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
PDCD1Q15116 PPP1R1AP1-201ENST00000525622 425 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
PDCD1Q15116 AP003066.2-201ENST00000529375 555 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
PDCD1Q15116 AC004923.2-201ENST00000529649 369 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
PDCD1Q15116 AC132192.1-201ENST00000531111 597 ntTSL 3 BASIC6.79□□□□□ -1.32
PDCD1Q15116 AP000756.1-201ENST00000532606 679 ntTSL 2 BASIC6.79□□□□□ -1.32
PDCD1Q15116 AL590560.1-203ENST00000544342 408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.79□□□□□ -1.32
PDCD1Q15116 AC078929.1-201ENST00000547679 502 ntTSL 3 BASIC6.79□□□□□ -1.32
PDCD1Q15116 AC036103.1-201ENST00000563846 823 ntTSL 5 BASIC6.79□□□□□ -1.32
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PDCD1Q15116 AC005726.4-201ENST00000582858 458 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
PDCD1Q15116 MIR4509-2-201ENST00000583920 94 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
PDCD1Q15116 AC008507.2-201ENST00000588402 1176 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
PDCD1Q15116 TEX26-AS1-211ENST00000589840 865 ntTSL 5 BASIC6.79□□□□□ -1.32
PDCD1Q15116 ZNF83-210ENST00000597161 509 ntTSL 4 BASIC6.79□□□□□ -1.32
PDCD1Q15116 AL391807.1-201ENST00000603261 712 ntTSL 5 BASIC6.79□□□□□ -1.32
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PDCD1Q15116 MIR4509-1-201ENST00000618224 94 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
PDCD1Q15116 AL136967.1-201ENST00000625120 441 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
PDCD1Q15116 LINC00598-212ENST00000637124 905 ntTSL 5 BASIC6.79□□□□□ -1.32
PDCD1Q15116 PHF2P2-202ENST00000444553 2865 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
PDCD1Q15116 TNS4-201ENST00000254051 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
PDCD1Q15116 AL137918.1-201ENST00000624542 1922 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
PDCD1Q15116 AIM2-202ENST00000368130 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
PDCD1Q15116 AGR2-203ENST00000419304 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
PDCD1Q15116 GLRX-202ENST00000379979 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
PDCD1Q15116 SAMM50P1-201ENST00000455403 1399 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
PDCD1Q15116 AC106800.1-201ENST00000501221 1362 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
PDCD1Q15116 SEPT4-216ENST00000580844 1396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.79□□□□□ -1.32
PDCD1Q15116 GOLGB1-209ENST00000614479 11115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
PDCD1Q15116 TMX2-201ENST00000278422 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
PDCD1Q15116 PRSS51-203ENST00000636217 2255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.79□□□□□ -1.32
PDCD1Q15116 IL16-204ENST00000394660 9616 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.79□□□□□ -1.32
PDCD1Q15116 AGO1-201ENST00000373204 13708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
PDCD1Q15116 ZFHX3-207ENST00000641206 16414 ntAPPRIS P1 BASIC6.79□□□□□ -1.32
PDCD1Q15116 HDAC9-201ENST00000401921 3254 ntTSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
PDCD1Q15116 SERPINB4-201ENST00000341074 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
PDCD1Q15116 PPIL1-201ENST00000373699 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
PDCD1Q15116 CA5B-201ENST00000318636 6835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
PDCD1Q15116 FAF2-201ENST00000261942 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
PDCD1Q15116 LINC01206-202ENST00000474045 2240 ntTSL 5 BASIC6.78□□□□□ -1.32
PDCD1Q15116 PLEKHS1-202ENST00000361048 3249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.78□□□□□ -1.32
PDCD1Q15116 NEDD9-208ENST00000504387 3211 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.78□□□□□ -1.32
PDCD1Q15116 PLEKHS1-207ENST00000619563 3247 ntTSL 5 BASIC6.78□□□□□ -1.32
PDCD1Q15116 FAM13C-216ENST00000618427 3458 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.78□□□□□ -1.32
PDCD1Q15116 RNASEL-201ENST00000367559 4238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
PDCD1Q15116 CDHR3-201ENST00000317716 3813 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
PDCD1Q15116 LPA-201ENST00000316300 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
PDCD1Q15116 LINC02282-201ENST00000535153 1655 ntTSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
PDCD1Q15116 C1QTNF7-201ENST00000295297 4516 ntTSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
PDCD1Q15116 SYCP1-202ENST00000369522 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
PDCD1Q15116 CHEK1-216ENST00000534070 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
PDCD1Q15116 AL512662.1-201ENST00000624850 2251 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
PDCD1Q15116 MIR17HG-202ENST00000581816 2032 ntTSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
PDCD1Q15116 FBXO36-202ENST00000373652 3120 ntTSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
PDCD1Q15116 HEPH-201ENST00000336279 4228 ntTSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
PDCD1Q15116 AC007382.1-201ENST00000624376 2618 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
PDCD1Q15116 OR5P2-201ENST00000329434 1069 ntAPPRIS P1 BASIC6.78□□□□□ -1.32
PDCD1Q15116 NUDT13-202ENST00000357321 2102 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.78□□□□□ -1.32
PDCD1Q15116 MRPL55-211ENST00000366738 705 ntTSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
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