Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6R9

CCDC61, Coiled-coil domain-containing protein 61, humanhuman

Predictions only

Length 512 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC61Q9Y6R9 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC27.51■■■□□ 2
CCDC61Q9Y6R9 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CCDC61Q9Y6R9 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CCDC61Q9Y6R9 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CCDC61Q9Y6R9 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CCDC61Q9Y6R9 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CCDC61Q9Y6R9 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CCDC61Q9Y6R9 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CCDC61Q9Y6R9 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CCDC61Q9Y6R9 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CCDC61Q9Y6R9 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CCDC61Q9Y6R9 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
CCDC61Q9Y6R9 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
CCDC61Q9Y6R9 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CCDC61Q9Y6R9 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
CCDC61Q9Y6R9 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CCDC61Q9Y6R9 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CCDC61Q9Y6R9 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CCDC61Q9Y6R9 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CCDC61Q9Y6R9 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CCDC61Q9Y6R9 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CCDC61Q9Y6R9 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
CCDC61Q9Y6R9 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CCDC61Q9Y6R9 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CCDC61Q9Y6R9 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CCDC61Q9Y6R9 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CCDC61Q9Y6R9 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CCDC61Q9Y6R9 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CCDC61Q9Y6R9 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CCDC61Q9Y6R9 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CCDC61Q9Y6R9 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CCDC61Q9Y6R9 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CCDC61Q9Y6R9 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CCDC61Q9Y6R9 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CCDC61Q9Y6R9 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
CCDC61Q9Y6R9 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CCDC61Q9Y6R9 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CCDC61Q9Y6R9 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CCDC61Q9Y6R9 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
CCDC61Q9Y6R9 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CCDC61Q9Y6R9 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CCDC61Q9Y6R9 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CCDC61Q9Y6R9 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CCDC61Q9Y6R9 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CCDC61Q9Y6R9 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CCDC61Q9Y6R9 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CCDC61Q9Y6R9 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CCDC61Q9Y6R9 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CCDC61Q9Y6R9 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CCDC61Q9Y6R9 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CCDC61Q9Y6R9 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CCDC61Q9Y6R9 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CCDC61Q9Y6R9 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CCDC61Q9Y6R9 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CCDC61Q9Y6R9 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CCDC61Q9Y6R9 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CCDC61Q9Y6R9 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CCDC61Q9Y6R9 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CCDC61Q9Y6R9 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CCDC61Q9Y6R9 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
CCDC61Q9Y6R9 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CCDC61Q9Y6R9 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CCDC61Q9Y6R9 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CCDC61Q9Y6R9 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CCDC61Q9Y6R9 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CCDC61Q9Y6R9 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
CCDC61Q9Y6R9 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CCDC61Q9Y6R9 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CCDC61Q9Y6R9 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CCDC61Q9Y6R9 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CCDC61Q9Y6R9 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CCDC61Q9Y6R9 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CCDC61Q9Y6R9 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CCDC61Q9Y6R9 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CCDC61Q9Y6R9 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CCDC61Q9Y6R9 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
CCDC61Q9Y6R9 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CCDC61Q9Y6R9 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CCDC61Q9Y6R9 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CCDC61Q9Y6R9 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
CCDC61Q9Y6R9 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CCDC61Q9Y6R9 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CCDC61Q9Y6R9 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CCDC61Q9Y6R9 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CCDC61Q9Y6R9 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CCDC61Q9Y6R9 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CCDC61Q9Y6R9 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
CCDC61Q9Y6R9 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
CCDC61Q9Y6R9 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.99
CCDC61Q9Y6R9 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
CCDC61Q9Y6R9 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
CCDC61Q9Y6R9 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
CCDC61Q9Y6R9 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
CCDC61Q9Y6R9 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
CCDC61Q9Y6R9 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
CCDC61Q9Y6R9 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
CCDC61Q9Y6R9 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
CCDC61Q9Y6R9 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
CCDC61Q9Y6R9 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
CCDC61Q9Y6R9 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms