Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2V7

COG6, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 6, humanhuman

Predictions only

Length 657 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COG6Q9Y2V7 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
COG6Q9Y2V7 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
COG6Q9Y2V7 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
COG6Q9Y2V7 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
COG6Q9Y2V7 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
COG6Q9Y2V7 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
COG6Q9Y2V7 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
COG6Q9Y2V7 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
COG6Q9Y2V7 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC25.48■■□□□ 1.67
COG6Q9Y2V7 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
COG6Q9Y2V7 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
COG6Q9Y2V7 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
COG6Q9Y2V7 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
COG6Q9Y2V7 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
COG6Q9Y2V7 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
COG6Q9Y2V7 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
COG6Q9Y2V7 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
COG6Q9Y2V7 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
COG6Q9Y2V7 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
COG6Q9Y2V7 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
COG6Q9Y2V7 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
COG6Q9Y2V7 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
COG6Q9Y2V7 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
COG6Q9Y2V7 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
COG6Q9Y2V7 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
COG6Q9Y2V7 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
COG6Q9Y2V7 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
COG6Q9Y2V7 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
COG6Q9Y2V7 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
COG6Q9Y2V7 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
COG6Q9Y2V7 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
COG6Q9Y2V7 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
COG6Q9Y2V7 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
COG6Q9Y2V7 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
COG6Q9Y2V7 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
COG6Q9Y2V7 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
COG6Q9Y2V7 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
COG6Q9Y2V7 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
COG6Q9Y2V7 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
COG6Q9Y2V7 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
COG6Q9Y2V7 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
COG6Q9Y2V7 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
COG6Q9Y2V7 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
COG6Q9Y2V7 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
COG6Q9Y2V7 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
COG6Q9Y2V7 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
COG6Q9Y2V7 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
COG6Q9Y2V7 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
COG6Q9Y2V7 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
COG6Q9Y2V7 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
COG6Q9Y2V7 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
COG6Q9Y2V7 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
COG6Q9Y2V7 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
COG6Q9Y2V7 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
COG6Q9Y2V7 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
COG6Q9Y2V7 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
COG6Q9Y2V7 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
COG6Q9Y2V7 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
COG6Q9Y2V7 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
COG6Q9Y2V7 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
COG6Q9Y2V7 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
COG6Q9Y2V7 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
COG6Q9Y2V7 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
COG6Q9Y2V7 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
COG6Q9Y2V7 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
COG6Q9Y2V7 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
COG6Q9Y2V7 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
COG6Q9Y2V7 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
COG6Q9Y2V7 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
COG6Q9Y2V7 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
COG6Q9Y2V7 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
COG6Q9Y2V7 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
COG6Q9Y2V7 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
COG6Q9Y2V7 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
COG6Q9Y2V7 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
COG6Q9Y2V7 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
COG6Q9Y2V7 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
COG6Q9Y2V7 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
COG6Q9Y2V7 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
COG6Q9Y2V7 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
COG6Q9Y2V7 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
COG6Q9Y2V7 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
COG6Q9Y2V7 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
COG6Q9Y2V7 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
COG6Q9Y2V7 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
COG6Q9Y2V7 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
COG6Q9Y2V7 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
COG6Q9Y2V7 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
COG6Q9Y2V7 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
COG6Q9Y2V7 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
COG6Q9Y2V7 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
COG6Q9Y2V7 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
COG6Q9Y2V7 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
COG6Q9Y2V7 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
COG6Q9Y2V7 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
COG6Q9Y2V7 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
COG6Q9Y2V7 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
COG6Q9Y2V7 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
COG6Q9Y2V7 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
COG6Q9Y2V7 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms