Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNY4

TTF2, Transcription termination factor 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,162 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTF2Q9UNY4 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TTF2Q9UNY4 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TTF2Q9UNY4 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TTF2Q9UNY4 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TTF2Q9UNY4 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TTF2Q9UNY4 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TTF2Q9UNY4 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TTF2Q9UNY4 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TTF2Q9UNY4 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TTF2Q9UNY4 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TTF2Q9UNY4 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TTF2Q9UNY4 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TTF2Q9UNY4 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TTF2Q9UNY4 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TTF2Q9UNY4 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
TTF2Q9UNY4 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TTF2Q9UNY4 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TTF2Q9UNY4 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TTF2Q9UNY4 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TTF2Q9UNY4 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TTF2Q9UNY4 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TTF2Q9UNY4 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TTF2Q9UNY4 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TTF2Q9UNY4 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TTF2Q9UNY4 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TTF2Q9UNY4 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TTF2Q9UNY4 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TTF2Q9UNY4 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TTF2Q9UNY4 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TTF2Q9UNY4 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TTF2Q9UNY4 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
TTF2Q9UNY4 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TTF2Q9UNY4 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TTF2Q9UNY4 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TTF2Q9UNY4 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TTF2Q9UNY4 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TTF2Q9UNY4 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TTF2Q9UNY4 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TTF2Q9UNY4 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TTF2Q9UNY4 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
TTF2Q9UNY4 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
TTF2Q9UNY4 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
TTF2Q9UNY4 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
TTF2Q9UNY4 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
TTF2Q9UNY4 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TTF2Q9UNY4 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TTF2Q9UNY4 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
TTF2Q9UNY4 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
TTF2Q9UNY4 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
TTF2Q9UNY4 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
TTF2Q9UNY4 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TTF2Q9UNY4 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TTF2Q9UNY4 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TTF2Q9UNY4 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TTF2Q9UNY4 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TTF2Q9UNY4 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
TTF2Q9UNY4 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TTF2Q9UNY4 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TTF2Q9UNY4 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TTF2Q9UNY4 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TTF2Q9UNY4 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TTF2Q9UNY4 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TTF2Q9UNY4 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TTF2Q9UNY4 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TTF2Q9UNY4 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TTF2Q9UNY4 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TTF2Q9UNY4 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TTF2Q9UNY4 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TTF2Q9UNY4 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TTF2Q9UNY4 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TTF2Q9UNY4 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TTF2Q9UNY4 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TTF2Q9UNY4 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
TTF2Q9UNY4 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TTF2Q9UNY4 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TTF2Q9UNY4 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TTF2Q9UNY4 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TTF2Q9UNY4 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TTF2Q9UNY4 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TTF2Q9UNY4 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TTF2Q9UNY4 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TTF2Q9UNY4 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
TTF2Q9UNY4 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
TTF2Q9UNY4 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
TTF2Q9UNY4 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
TTF2Q9UNY4 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TTF2Q9UNY4 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TTF2Q9UNY4 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TTF2Q9UNY4 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TTF2Q9UNY4 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TTF2Q9UNY4 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TTF2Q9UNY4 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TTF2Q9UNY4 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TTF2Q9UNY4 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TTF2Q9UNY4 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TTF2Q9UNY4 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
TTF2Q9UNY4 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TTF2Q9UNY4 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TTF2Q9UNY4 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TTF2Q9UNY4 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms