Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKL4

GJD2, Gap junction delta-2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 321 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJD2Q9UKL4 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GJD2Q9UKL4 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GJD2Q9UKL4 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GJD2Q9UKL4 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GJD2Q9UKL4 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GJD2Q9UKL4 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GJD2Q9UKL4 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GJD2Q9UKL4 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GJD2Q9UKL4 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GJD2Q9UKL4 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GJD2Q9UKL4 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GJD2Q9UKL4 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GJD2Q9UKL4 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GJD2Q9UKL4 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GJD2Q9UKL4 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GJD2Q9UKL4 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GJD2Q9UKL4 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GJD2Q9UKL4 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GJD2Q9UKL4 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GJD2Q9UKL4 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GJD2Q9UKL4 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
GJD2Q9UKL4 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GJD2Q9UKL4 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GJD2Q9UKL4 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GJD2Q9UKL4 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GJD2Q9UKL4 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GJD2Q9UKL4 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GJD2Q9UKL4 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GJD2Q9UKL4 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GJD2Q9UKL4 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
GJD2Q9UKL4 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GJD2Q9UKL4 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
GJD2Q9UKL4 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GJD2Q9UKL4 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GJD2Q9UKL4 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GJD2Q9UKL4 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GJD2Q9UKL4 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GJD2Q9UKL4 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GJD2Q9UKL4 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GJD2Q9UKL4 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GJD2Q9UKL4 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GJD2Q9UKL4 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GJD2Q9UKL4 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GJD2Q9UKL4 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
GJD2Q9UKL4 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
GJD2Q9UKL4 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GJD2Q9UKL4 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GJD2Q9UKL4 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GJD2Q9UKL4 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GJD2Q9UKL4 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GJD2Q9UKL4 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GJD2Q9UKL4 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GJD2Q9UKL4 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GJD2Q9UKL4 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GJD2Q9UKL4 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GJD2Q9UKL4 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GJD2Q9UKL4 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
GJD2Q9UKL4 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
GJD2Q9UKL4 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GJD2Q9UKL4 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GJD2Q9UKL4 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GJD2Q9UKL4 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GJD2Q9UKL4 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GJD2Q9UKL4 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
GJD2Q9UKL4 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GJD2Q9UKL4 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GJD2Q9UKL4 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GJD2Q9UKL4 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GJD2Q9UKL4 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GJD2Q9UKL4 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GJD2Q9UKL4 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
GJD2Q9UKL4 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
GJD2Q9UKL4 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GJD2Q9UKL4 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GJD2Q9UKL4 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GJD2Q9UKL4 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GJD2Q9UKL4 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GJD2Q9UKL4 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GJD2Q9UKL4 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GJD2Q9UKL4 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GJD2Q9UKL4 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GJD2Q9UKL4 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GJD2Q9UKL4 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GJD2Q9UKL4 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
GJD2Q9UKL4 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GJD2Q9UKL4 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GJD2Q9UKL4 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GJD2Q9UKL4 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GJD2Q9UKL4 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GJD2Q9UKL4 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GJD2Q9UKL4 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GJD2Q9UKL4 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
GJD2Q9UKL4 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GJD2Q9UKL4 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GJD2Q9UKL4 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
GJD2Q9UKL4 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GJD2Q9UKL4 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
GJD2Q9UKL4 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
GJD2Q9UKL4 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GJD2Q9UKL4 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.6 ms