Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKD2

MRTO4, mRNA turnover protein 4 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 239 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRTO4Q9UKD2 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
MRTO4Q9UKD2 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
MRTO4Q9UKD2 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
MRTO4Q9UKD2 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.59■□□□□ 0.57
MRTO4Q9UKD2 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
MRTO4Q9UKD2 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
MRTO4Q9UKD2 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
MRTO4Q9UKD2 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
MRTO4Q9UKD2 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
MRTO4Q9UKD2 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
MRTO4Q9UKD2 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
MRTO4Q9UKD2 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
MRTO4Q9UKD2 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
MRTO4Q9UKD2 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
MRTO4Q9UKD2 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
MRTO4Q9UKD2 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
MRTO4Q9UKD2 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
MRTO4Q9UKD2 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
MRTO4Q9UKD2 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
MRTO4Q9UKD2 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
MRTO4Q9UKD2 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
MRTO4Q9UKD2 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
MRTO4Q9UKD2 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
MRTO4Q9UKD2 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.57
MRTO4Q9UKD2 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
MRTO4Q9UKD2 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
MRTO4Q9UKD2 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
MRTO4Q9UKD2 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
MRTO4Q9UKD2 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
MRTO4Q9UKD2 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
MRTO4Q9UKD2 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
MRTO4Q9UKD2 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
MRTO4Q9UKD2 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
MRTO4Q9UKD2 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
MRTO4Q9UKD2 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
MRTO4Q9UKD2 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
MRTO4Q9UKD2 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
MRTO4Q9UKD2 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
MRTO4Q9UKD2 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
MRTO4Q9UKD2 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
MRTO4Q9UKD2 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
MRTO4Q9UKD2 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
MRTO4Q9UKD2 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
MRTO4Q9UKD2 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
MRTO4Q9UKD2 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
MRTO4Q9UKD2 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
MRTO4Q9UKD2 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
MRTO4Q9UKD2 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
MRTO4Q9UKD2 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
MRTO4Q9UKD2 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
MRTO4Q9UKD2 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
MRTO4Q9UKD2 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
MRTO4Q9UKD2 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
MRTO4Q9UKD2 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
MRTO4Q9UKD2 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
MRTO4Q9UKD2 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
MRTO4Q9UKD2 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
MRTO4Q9UKD2 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
MRTO4Q9UKD2 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC18.57■□□□□ 0.56
MRTO4Q9UKD2 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
MRTO4Q9UKD2 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
MRTO4Q9UKD2 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
MRTO4Q9UKD2 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
MRTO4Q9UKD2 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
MRTO4Q9UKD2 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
MRTO4Q9UKD2 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
MRTO4Q9UKD2 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
MRTO4Q9UKD2 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
MRTO4Q9UKD2 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
MRTO4Q9UKD2 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
MRTO4Q9UKD2 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
MRTO4Q9UKD2 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
MRTO4Q9UKD2 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
MRTO4Q9UKD2 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
MRTO4Q9UKD2 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
MRTO4Q9UKD2 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
MRTO4Q9UKD2 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
MRTO4Q9UKD2 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
MRTO4Q9UKD2 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
MRTO4Q9UKD2 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
MRTO4Q9UKD2 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
MRTO4Q9UKD2 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
MRTO4Q9UKD2 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
MRTO4Q9UKD2 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
MRTO4Q9UKD2 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
MRTO4Q9UKD2 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
MRTO4Q9UKD2 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
MRTO4Q9UKD2 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
MRTO4Q9UKD2 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
MRTO4Q9UKD2 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
MRTO4Q9UKD2 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
MRTO4Q9UKD2 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
MRTO4Q9UKD2 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
MRTO4Q9UKD2 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
MRTO4Q9UKD2 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
MRTO4Q9UKD2 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
MRTO4Q9UKD2 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
MRTO4Q9UKD2 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
MRTO4Q9UKD2 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
MRTO4Q9UKD2 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms