Protein–RNA interactions for Protein: Q9UH90

FBXO40, F-box only protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXO40Q9UH90 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
FBXO40Q9UH90 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
FBXO40Q9UH90 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
FBXO40Q9UH90 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
FBXO40Q9UH90 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
FBXO40Q9UH90 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
FBXO40Q9UH90 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
FBXO40Q9UH90 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
FBXO40Q9UH90 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
FBXO40Q9UH90 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
FBXO40Q9UH90 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
FBXO40Q9UH90 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
FBXO40Q9UH90 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
FBXO40Q9UH90 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
FBXO40Q9UH90 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
FBXO40Q9UH90 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
FBXO40Q9UH90 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
FBXO40Q9UH90 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
FBXO40Q9UH90 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
FBXO40Q9UH90 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
FBXO40Q9UH90 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
FBXO40Q9UH90 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
FBXO40Q9UH90 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
FBXO40Q9UH90 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
FBXO40Q9UH90 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
FBXO40Q9UH90 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
FBXO40Q9UH90 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
FBXO40Q9UH90 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
FBXO40Q9UH90 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
FBXO40Q9UH90 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
FBXO40Q9UH90 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
FBXO40Q9UH90 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
FBXO40Q9UH90 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
FBXO40Q9UH90 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
FBXO40Q9UH90 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
FBXO40Q9UH90 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
FBXO40Q9UH90 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
FBXO40Q9UH90 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
FBXO40Q9UH90 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
FBXO40Q9UH90 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
FBXO40Q9UH90 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
FBXO40Q9UH90 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
FBXO40Q9UH90 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
FBXO40Q9UH90 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
FBXO40Q9UH90 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
FBXO40Q9UH90 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
FBXO40Q9UH90 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
FBXO40Q9UH90 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
FBXO40Q9UH90 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
FBXO40Q9UH90 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
FBXO40Q9UH90 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
FBXO40Q9UH90 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
FBXO40Q9UH90 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
FBXO40Q9UH90 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
FBXO40Q9UH90 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
FBXO40Q9UH90 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
FBXO40Q9UH90 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
FBXO40Q9UH90 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
FBXO40Q9UH90 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
FBXO40Q9UH90 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
FBXO40Q9UH90 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
FBXO40Q9UH90 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
FBXO40Q9UH90 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
FBXO40Q9UH90 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
FBXO40Q9UH90 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
FBXO40Q9UH90 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
FBXO40Q9UH90 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
FBXO40Q9UH90 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
FBXO40Q9UH90 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
FBXO40Q9UH90 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
FBXO40Q9UH90 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
FBXO40Q9UH90 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
FBXO40Q9UH90 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
FBXO40Q9UH90 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
FBXO40Q9UH90 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
FBXO40Q9UH90 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
FBXO40Q9UH90 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
FBXO40Q9UH90 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
FBXO40Q9UH90 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.24
FBXO40Q9UH90 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
FBXO40Q9UH90 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
FBXO40Q9UH90 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
FBXO40Q9UH90 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
FBXO40Q9UH90 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
FBXO40Q9UH90 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
FBXO40Q9UH90 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
FBXO40Q9UH90 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
FBXO40Q9UH90 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
FBXO40Q9UH90 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
FBXO40Q9UH90 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
FBXO40Q9UH90 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
FBXO40Q9UH90 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
FBXO40Q9UH90 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
FBXO40Q9UH90 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
FBXO40Q9UH90 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
FBXO40Q9UH90 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
FBXO40Q9UH90 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
FBXO40Q9UH90 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
FBXO40Q9UH90 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
FBXO40Q9UH90 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms