Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBF6

RNF7, RING-box protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 113 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF7Q9UBF6 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
RNF7Q9UBF6 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
RNF7Q9UBF6 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
RNF7Q9UBF6 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
RNF7Q9UBF6 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
RNF7Q9UBF6 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
RNF7Q9UBF6 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
RNF7Q9UBF6 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
RNF7Q9UBF6 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RNF7Q9UBF6 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RNF7Q9UBF6 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC16.88■□□□□ 0.29
RNF7Q9UBF6 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
RNF7Q9UBF6 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RNF7Q9UBF6 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
RNF7Q9UBF6 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RNF7Q9UBF6 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
RNF7Q9UBF6 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RNF7Q9UBF6 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RNF7Q9UBF6 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RNF7Q9UBF6 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC16.88■□□□□ 0.29
RNF7Q9UBF6 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
RNF7Q9UBF6 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
RNF7Q9UBF6 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
RNF7Q9UBF6 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC16.88■□□□□ 0.29
RNF7Q9UBF6 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
RNF7Q9UBF6 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
RNF7Q9UBF6 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
RNF7Q9UBF6 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
RNF7Q9UBF6 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RNF7Q9UBF6 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
RNF7Q9UBF6 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RNF7Q9UBF6 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
RNF7Q9UBF6 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RNF7Q9UBF6 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RNF7Q9UBF6 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
RNF7Q9UBF6 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
RNF7Q9UBF6 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
RNF7Q9UBF6 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
RNF7Q9UBF6 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
RNF7Q9UBF6 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
RNF7Q9UBF6 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
RNF7Q9UBF6 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
RNF7Q9UBF6 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
RNF7Q9UBF6 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
RNF7Q9UBF6 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
RNF7Q9UBF6 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
RNF7Q9UBF6 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
RNF7Q9UBF6 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
RNF7Q9UBF6 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
RNF7Q9UBF6 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
RNF7Q9UBF6 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
RNF7Q9UBF6 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
RNF7Q9UBF6 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
RNF7Q9UBF6 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
RNF7Q9UBF6 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
RNF7Q9UBF6 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
RNF7Q9UBF6 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
RNF7Q9UBF6 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
RNF7Q9UBF6 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
RNF7Q9UBF6 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
RNF7Q9UBF6 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
RNF7Q9UBF6 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
RNF7Q9UBF6 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
RNF7Q9UBF6 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
RNF7Q9UBF6 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
RNF7Q9UBF6 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RNF7Q9UBF6 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RNF7Q9UBF6 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
RNF7Q9UBF6 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
RNF7Q9UBF6 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RNF7Q9UBF6 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RNF7Q9UBF6 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RNF7Q9UBF6 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
RNF7Q9UBF6 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RNF7Q9UBF6 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
RNF7Q9UBF6 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
RNF7Q9UBF6 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
RNF7Q9UBF6 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
RNF7Q9UBF6 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
RNF7Q9UBF6 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
RNF7Q9UBF6 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RNF7Q9UBF6 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RNF7Q9UBF6 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
RNF7Q9UBF6 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RNF7Q9UBF6 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
RNF7Q9UBF6 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RNF7Q9UBF6 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RNF7Q9UBF6 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RNF7Q9UBF6 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RNF7Q9UBF6 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RNF7Q9UBF6 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
RNF7Q9UBF6 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
RNF7Q9UBF6 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RNF7Q9UBF6 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
RNF7Q9UBF6 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
RNF7Q9UBF6 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
RNF7Q9UBF6 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RNF7Q9UBF6 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
RNF7Q9UBF6 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RNF7Q9UBF6 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms