Protein–RNA interactions for Protein: Q9NY46

SCN3A, Sodium channel protein type 3 subunit alpha, humanhuman

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Length 2,000 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN3AQ9NY46 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SCN3AQ9NY46 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SCN3AQ9NY46 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
SCN3AQ9NY46 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SCN3AQ9NY46 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SCN3AQ9NY46 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SCN3AQ9NY46 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SCN3AQ9NY46 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SCN3AQ9NY46 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SCN3AQ9NY46 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SCN3AQ9NY46 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SCN3AQ9NY46 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SCN3AQ9NY46 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SCN3AQ9NY46 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SCN3AQ9NY46 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SCN3AQ9NY46 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SCN3AQ9NY46 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SCN3AQ9NY46 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SCN3AQ9NY46 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SCN3AQ9NY46 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SCN3AQ9NY46 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SCN3AQ9NY46 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SCN3AQ9NY46 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SCN3AQ9NY46 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
SCN3AQ9NY46 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SCN3AQ9NY46 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SCN3AQ9NY46 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SCN3AQ9NY46 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SCN3AQ9NY46 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SCN3AQ9NY46 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SCN3AQ9NY46 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SCN3AQ9NY46 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SCN3AQ9NY46 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SCN3AQ9NY46 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SCN3AQ9NY46 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SCN3AQ9NY46 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SCN3AQ9NY46 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SCN3AQ9NY46 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SCN3AQ9NY46 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SCN3AQ9NY46 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
SCN3AQ9NY46 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SCN3AQ9NY46 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SCN3AQ9NY46 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SCN3AQ9NY46 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SCN3AQ9NY46 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SCN3AQ9NY46 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SCN3AQ9NY46 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
SCN3AQ9NY46 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
SCN3AQ9NY46 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SCN3AQ9NY46 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SCN3AQ9NY46 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SCN3AQ9NY46 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SCN3AQ9NY46 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SCN3AQ9NY46 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SCN3AQ9NY46 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SCN3AQ9NY46 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SCN3AQ9NY46 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SCN3AQ9NY46 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
SCN3AQ9NY46 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SCN3AQ9NY46 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SCN3AQ9NY46 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
SCN3AQ9NY46 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SCN3AQ9NY46 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SCN3AQ9NY46 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SCN3AQ9NY46 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SCN3AQ9NY46 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SCN3AQ9NY46 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SCN3AQ9NY46 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
SCN3AQ9NY46 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SCN3AQ9NY46 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SCN3AQ9NY46 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
SCN3AQ9NY46 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SCN3AQ9NY46 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SCN3AQ9NY46 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SCN3AQ9NY46 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SCN3AQ9NY46 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SCN3AQ9NY46 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SCN3AQ9NY46 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SCN3AQ9NY46 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SCN3AQ9NY46 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SCN3AQ9NY46 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SCN3AQ9NY46 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SCN3AQ9NY46 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SCN3AQ9NY46 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SCN3AQ9NY46 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SCN3AQ9NY46 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SCN3AQ9NY46 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SCN3AQ9NY46 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SCN3AQ9NY46 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
SCN3AQ9NY46 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SCN3AQ9NY46 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SCN3AQ9NY46 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SCN3AQ9NY46 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SCN3AQ9NY46 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SCN3AQ9NY46 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SCN3AQ9NY46 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SCN3AQ9NY46 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SCN3AQ9NY46 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SCN3AQ9NY46 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SCN3AQ9NY46 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
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