Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSI8

SAMSN1, SAM domain-containing protein SAMSN-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMSN1Q9NSI8 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SAMSN1Q9NSI8 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SAMSN1Q9NSI8 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SAMSN1Q9NSI8 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SAMSN1Q9NSI8 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SAMSN1Q9NSI8 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SAMSN1Q9NSI8 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SAMSN1Q9NSI8 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SAMSN1Q9NSI8 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SAMSN1Q9NSI8 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SAMSN1Q9NSI8 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
SAMSN1Q9NSI8 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SAMSN1Q9NSI8 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SAMSN1Q9NSI8 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SAMSN1Q9NSI8 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SAMSN1Q9NSI8 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SAMSN1Q9NSI8 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SAMSN1Q9NSI8 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SAMSN1Q9NSI8 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SAMSN1Q9NSI8 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SAMSN1Q9NSI8 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SAMSN1Q9NSI8 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SAMSN1Q9NSI8 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SAMSN1Q9NSI8 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SAMSN1Q9NSI8 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SAMSN1Q9NSI8 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SAMSN1Q9NSI8 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SAMSN1Q9NSI8 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SAMSN1Q9NSI8 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SAMSN1Q9NSI8 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SAMSN1Q9NSI8 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SAMSN1Q9NSI8 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SAMSN1Q9NSI8 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SAMSN1Q9NSI8 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SAMSN1Q9NSI8 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SAMSN1Q9NSI8 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SAMSN1Q9NSI8 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SAMSN1Q9NSI8 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SAMSN1Q9NSI8 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SAMSN1Q9NSI8 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SAMSN1Q9NSI8 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SAMSN1Q9NSI8 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SAMSN1Q9NSI8 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SAMSN1Q9NSI8 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SAMSN1Q9NSI8 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SAMSN1Q9NSI8 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SAMSN1Q9NSI8 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SAMSN1Q9NSI8 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SAMSN1Q9NSI8 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SAMSN1Q9NSI8 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SAMSN1Q9NSI8 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SAMSN1Q9NSI8 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SAMSN1Q9NSI8 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SAMSN1Q9NSI8 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SAMSN1Q9NSI8 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SAMSN1Q9NSI8 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SAMSN1Q9NSI8 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SAMSN1Q9NSI8 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SAMSN1Q9NSI8 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SAMSN1Q9NSI8 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SAMSN1Q9NSI8 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SAMSN1Q9NSI8 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SAMSN1Q9NSI8 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SAMSN1Q9NSI8 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SAMSN1Q9NSI8 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SAMSN1Q9NSI8 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SAMSN1Q9NSI8 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SAMSN1Q9NSI8 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SAMSN1Q9NSI8 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SAMSN1Q9NSI8 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
SAMSN1Q9NSI8 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SAMSN1Q9NSI8 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SAMSN1Q9NSI8 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SAMSN1Q9NSI8 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SAMSN1Q9NSI8 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SAMSN1Q9NSI8 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SAMSN1Q9NSI8 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SAMSN1Q9NSI8 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SAMSN1Q9NSI8 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SAMSN1Q9NSI8 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SAMSN1Q9NSI8 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SAMSN1Q9NSI8 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SAMSN1Q9NSI8 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SAMSN1Q9NSI8 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
SAMSN1Q9NSI8 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SAMSN1Q9NSI8 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SAMSN1Q9NSI8 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SAMSN1Q9NSI8 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SAMSN1Q9NSI8 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SAMSN1Q9NSI8 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SAMSN1Q9NSI8 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SAMSN1Q9NSI8 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SAMSN1Q9NSI8 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SAMSN1Q9NSI8 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SAMSN1Q9NSI8 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SAMSN1Q9NSI8 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SAMSN1Q9NSI8 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
SAMSN1Q9NSI8 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SAMSN1Q9NSI8 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SAMSN1Q9NSI8 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms