Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS56

TOPORS, E3 ubiquitin-protein ligase Topors, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,045 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOPORSQ9NS56 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TOPORSQ9NS56 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TOPORSQ9NS56 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TOPORSQ9NS56 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TOPORSQ9NS56 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TOPORSQ9NS56 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TOPORSQ9NS56 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TOPORSQ9NS56 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
TOPORSQ9NS56 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TOPORSQ9NS56 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TOPORSQ9NS56 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TOPORSQ9NS56 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TOPORSQ9NS56 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TOPORSQ9NS56 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TOPORSQ9NS56 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TOPORSQ9NS56 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TOPORSQ9NS56 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TOPORSQ9NS56 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TOPORSQ9NS56 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TOPORSQ9NS56 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TOPORSQ9NS56 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
TOPORSQ9NS56 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TOPORSQ9NS56 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TOPORSQ9NS56 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TOPORSQ9NS56 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TOPORSQ9NS56 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TOPORSQ9NS56 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TOPORSQ9NS56 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
TOPORSQ9NS56 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TOPORSQ9NS56 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
TOPORSQ9NS56 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TOPORSQ9NS56 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TOPORSQ9NS56 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TOPORSQ9NS56 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TOPORSQ9NS56 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TOPORSQ9NS56 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TOPORSQ9NS56 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TOPORSQ9NS56 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TOPORSQ9NS56 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TOPORSQ9NS56 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TOPORSQ9NS56 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TOPORSQ9NS56 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
TOPORSQ9NS56 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
TOPORSQ9NS56 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TOPORSQ9NS56 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TOPORSQ9NS56 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
TOPORSQ9NS56 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TOPORSQ9NS56 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TOPORSQ9NS56 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TOPORSQ9NS56 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TOPORSQ9NS56 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
TOPORSQ9NS56 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TOPORSQ9NS56 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TOPORSQ9NS56 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TOPORSQ9NS56 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TOPORSQ9NS56 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TOPORSQ9NS56 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TOPORSQ9NS56 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TOPORSQ9NS56 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TOPORSQ9NS56 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TOPORSQ9NS56 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TOPORSQ9NS56 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TOPORSQ9NS56 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TOPORSQ9NS56 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TOPORSQ9NS56 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TOPORSQ9NS56 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TOPORSQ9NS56 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TOPORSQ9NS56 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TOPORSQ9NS56 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TOPORSQ9NS56 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TOPORSQ9NS56 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TOPORSQ9NS56 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
TOPORSQ9NS56 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TOPORSQ9NS56 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TOPORSQ9NS56 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TOPORSQ9NS56 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TOPORSQ9NS56 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TOPORSQ9NS56 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TOPORSQ9NS56 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TOPORSQ9NS56 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TOPORSQ9NS56 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TOPORSQ9NS56 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TOPORSQ9NS56 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TOPORSQ9NS56 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TOPORSQ9NS56 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TOPORSQ9NS56 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TOPORSQ9NS56 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TOPORSQ9NS56 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TOPORSQ9NS56 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TOPORSQ9NS56 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TOPORSQ9NS56 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TOPORSQ9NS56 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TOPORSQ9NS56 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TOPORSQ9NS56 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TOPORSQ9NS56 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TOPORSQ9NS56 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TOPORSQ9NS56 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TOPORSQ9NS56 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TOPORSQ9NS56 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TOPORSQ9NS56 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms