Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRJ4

TULP4, Tubby-related protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TULP4Q9NRJ4 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
TULP4Q9NRJ4 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
TULP4Q9NRJ4 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
TULP4Q9NRJ4 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
TULP4Q9NRJ4 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
TULP4Q9NRJ4 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
TULP4Q9NRJ4 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
TULP4Q9NRJ4 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
TULP4Q9NRJ4 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
TULP4Q9NRJ4 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
TULP4Q9NRJ4 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
TULP4Q9NRJ4 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
TULP4Q9NRJ4 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
TULP4Q9NRJ4 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
TULP4Q9NRJ4 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC27.83■■■□□ 2.05
TULP4Q9NRJ4 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
TULP4Q9NRJ4 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
TULP4Q9NRJ4 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
TULP4Q9NRJ4 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
TULP4Q9NRJ4 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
TULP4Q9NRJ4 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
TULP4Q9NRJ4 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
TULP4Q9NRJ4 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
TULP4Q9NRJ4 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
TULP4Q9NRJ4 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
TULP4Q9NRJ4 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
TULP4Q9NRJ4 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
TULP4Q9NRJ4 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
TULP4Q9NRJ4 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
TULP4Q9NRJ4 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
TULP4Q9NRJ4 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
TULP4Q9NRJ4 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
TULP4Q9NRJ4 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
TULP4Q9NRJ4 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
TULP4Q9NRJ4 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
TULP4Q9NRJ4 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
TULP4Q9NRJ4 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
TULP4Q9NRJ4 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
TULP4Q9NRJ4 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
TULP4Q9NRJ4 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
TULP4Q9NRJ4 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
TULP4Q9NRJ4 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
TULP4Q9NRJ4 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
TULP4Q9NRJ4 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
TULP4Q9NRJ4 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
TULP4Q9NRJ4 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
TULP4Q9NRJ4 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
TULP4Q9NRJ4 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC27.8■■■□□ 2.04
TULP4Q9NRJ4 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC27.8■■■□□ 2.04
TULP4Q9NRJ4 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
TULP4Q9NRJ4 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
TULP4Q9NRJ4 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
TULP4Q9NRJ4 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
TULP4Q9NRJ4 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
TULP4Q9NRJ4 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
TULP4Q9NRJ4 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
TULP4Q9NRJ4 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
TULP4Q9NRJ4 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
TULP4Q9NRJ4 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
TULP4Q9NRJ4 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
TULP4Q9NRJ4 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
TULP4Q9NRJ4 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
TULP4Q9NRJ4 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC27.79■■■□□ 2.04
TULP4Q9NRJ4 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
TULP4Q9NRJ4 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
TULP4Q9NRJ4 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
TULP4Q9NRJ4 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
TULP4Q9NRJ4 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
TULP4Q9NRJ4 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
TULP4Q9NRJ4 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
TULP4Q9NRJ4 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
TULP4Q9NRJ4 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC27.78■■■□□ 2.04
TULP4Q9NRJ4 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
TULP4Q9NRJ4 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
TULP4Q9NRJ4 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
TULP4Q9NRJ4 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
TULP4Q9NRJ4 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
TULP4Q9NRJ4 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
TULP4Q9NRJ4 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
TULP4Q9NRJ4 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC27.77■■■□□ 2.04
TULP4Q9NRJ4 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC27.77■■■□□ 2.04
TULP4Q9NRJ4 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
TULP4Q9NRJ4 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
TULP4Q9NRJ4 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
TULP4Q9NRJ4 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
TULP4Q9NRJ4 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
TULP4Q9NRJ4 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
TULP4Q9NRJ4 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
TULP4Q9NRJ4 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
TULP4Q9NRJ4 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
TULP4Q9NRJ4 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC27.77■■■□□ 2.04
TULP4Q9NRJ4 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
TULP4Q9NRJ4 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.04
TULP4Q9NRJ4 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.04
TULP4Q9NRJ4 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
TULP4Q9NRJ4 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
TULP4Q9NRJ4 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
TULP4Q9NRJ4 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC27.76■■■□□ 2.03
TULP4Q9NRJ4 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC27.75■■■□□ 2.03
TULP4Q9NRJ4 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms