Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6U6

BCAS3, Breast carcinoma-amplified sequence 3, humanhuman

Predictions only

Length 928 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCAS3Q9H6U6 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
BCAS3Q9H6U6 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
BCAS3Q9H6U6 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
BCAS3Q9H6U6 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
BCAS3Q9H6U6 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
BCAS3Q9H6U6 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
BCAS3Q9H6U6 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
BCAS3Q9H6U6 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
BCAS3Q9H6U6 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
BCAS3Q9H6U6 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
BCAS3Q9H6U6 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
BCAS3Q9H6U6 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
BCAS3Q9H6U6 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
BCAS3Q9H6U6 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
BCAS3Q9H6U6 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
BCAS3Q9H6U6 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
BCAS3Q9H6U6 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
BCAS3Q9H6U6 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
BCAS3Q9H6U6 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
BCAS3Q9H6U6 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
BCAS3Q9H6U6 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
BCAS3Q9H6U6 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
BCAS3Q9H6U6 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
BCAS3Q9H6U6 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
BCAS3Q9H6U6 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
BCAS3Q9H6U6 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
BCAS3Q9H6U6 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
BCAS3Q9H6U6 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
BCAS3Q9H6U6 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
BCAS3Q9H6U6 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
BCAS3Q9H6U6 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
BCAS3Q9H6U6 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
BCAS3Q9H6U6 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
BCAS3Q9H6U6 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
BCAS3Q9H6U6 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
BCAS3Q9H6U6 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
BCAS3Q9H6U6 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
BCAS3Q9H6U6 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
BCAS3Q9H6U6 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
BCAS3Q9H6U6 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
BCAS3Q9H6U6 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
BCAS3Q9H6U6 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
BCAS3Q9H6U6 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
BCAS3Q9H6U6 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
BCAS3Q9H6U6 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
BCAS3Q9H6U6 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
BCAS3Q9H6U6 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
BCAS3Q9H6U6 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
BCAS3Q9H6U6 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
BCAS3Q9H6U6 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
BCAS3Q9H6U6 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
BCAS3Q9H6U6 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
BCAS3Q9H6U6 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
BCAS3Q9H6U6 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
BCAS3Q9H6U6 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
BCAS3Q9H6U6 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
BCAS3Q9H6U6 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
BCAS3Q9H6U6 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
BCAS3Q9H6U6 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
BCAS3Q9H6U6 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
BCAS3Q9H6U6 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
BCAS3Q9H6U6 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
BCAS3Q9H6U6 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
BCAS3Q9H6U6 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
BCAS3Q9H6U6 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
BCAS3Q9H6U6 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
BCAS3Q9H6U6 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
BCAS3Q9H6U6 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
BCAS3Q9H6U6 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
BCAS3Q9H6U6 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
BCAS3Q9H6U6 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
BCAS3Q9H6U6 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
BCAS3Q9H6U6 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
BCAS3Q9H6U6 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
BCAS3Q9H6U6 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
BCAS3Q9H6U6 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
BCAS3Q9H6U6 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
BCAS3Q9H6U6 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
BCAS3Q9H6U6 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
BCAS3Q9H6U6 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
BCAS3Q9H6U6 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
BCAS3Q9H6U6 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
BCAS3Q9H6U6 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
BCAS3Q9H6U6 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
BCAS3Q9H6U6 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
BCAS3Q9H6U6 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
BCAS3Q9H6U6 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
BCAS3Q9H6U6 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
BCAS3Q9H6U6 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
BCAS3Q9H6U6 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
BCAS3Q9H6U6 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
BCAS3Q9H6U6 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
BCAS3Q9H6U6 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
BCAS3Q9H6U6 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
BCAS3Q9H6U6 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
BCAS3Q9H6U6 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
BCAS3Q9H6U6 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
BCAS3Q9H6U6 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
BCAS3Q9H6U6 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
BCAS3Q9H6U6 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms