Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6F5

CCDC86, Coiled-coil domain-containing protein 86, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC86Q9H6F5 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC86Q9H6F5 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC86Q9H6F5 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC86Q9H6F5 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC86Q9H6F5 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC86Q9H6F5 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC86Q9H6F5 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC86Q9H6F5 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC86Q9H6F5 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC86Q9H6F5 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC86Q9H6F5 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC86Q9H6F5 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC86Q9H6F5 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC86Q9H6F5 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC86Q9H6F5 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC86Q9H6F5 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC86Q9H6F5 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC86Q9H6F5 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC86Q9H6F5 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC86Q9H6F5 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC86Q9H6F5 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC86Q9H6F5 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC86Q9H6F5 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC86Q9H6F5 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC86Q9H6F5 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC86Q9H6F5 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC86Q9H6F5 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC86Q9H6F5 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC86Q9H6F5 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC86Q9H6F5 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC86Q9H6F5 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC86Q9H6F5 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC86Q9H6F5 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC86Q9H6F5 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC86Q9H6F5 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC86Q9H6F5 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC86Q9H6F5 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC86Q9H6F5 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC86Q9H6F5 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC86Q9H6F5 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC86Q9H6F5 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC86Q9H6F5 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC86Q9H6F5 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC86Q9H6F5 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC86Q9H6F5 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC86Q9H6F5 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC86Q9H6F5 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC86Q9H6F5 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC86Q9H6F5 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC86Q9H6F5 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC86Q9H6F5 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC86Q9H6F5 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC86Q9H6F5 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC86Q9H6F5 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC86Q9H6F5 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC86Q9H6F5 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC86Q9H6F5 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC86Q9H6F5 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC86Q9H6F5 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC86Q9H6F5 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC86Q9H6F5 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC86Q9H6F5 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC86Q9H6F5 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC86Q9H6F5 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC86Q9H6F5 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC86Q9H6F5 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC86Q9H6F5 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC86Q9H6F5 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC86Q9H6F5 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC86Q9H6F5 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC86Q9H6F5 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC86Q9H6F5 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCDC86Q9H6F5 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCDC86Q9H6F5 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
CCDC86Q9H6F5 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCDC86Q9H6F5 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCDC86Q9H6F5 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCDC86Q9H6F5 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCDC86Q9H6F5 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCDC86Q9H6F5 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCDC86Q9H6F5 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
CCDC86Q9H6F5 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCDC86Q9H6F5 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCDC86Q9H6F5 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCDC86Q9H6F5 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCDC86Q9H6F5 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCDC86Q9H6F5 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCDC86Q9H6F5 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCDC86Q9H6F5 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCDC86Q9H6F5 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCDC86Q9H6F5 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCDC86Q9H6F5 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCDC86Q9H6F5 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCDC86Q9H6F5 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCDC86Q9H6F5 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCDC86Q9H6F5 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCDC86Q9H6F5 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCDC86Q9H6F5 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCDC86Q9H6F5 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCDC86Q9H6F5 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms