Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZ95

NSD3, Histone-lysine N-methyltransferase NSD3, humanhuman

Predictions only

Length 1,437 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NSD3Q9BZ95 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
NSD3Q9BZ95 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
NSD3Q9BZ95 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
NSD3Q9BZ95 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC27.28■■□□□ 1.96
NSD3Q9BZ95 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
NSD3Q9BZ95 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
NSD3Q9BZ95 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
NSD3Q9BZ95 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
NSD3Q9BZ95 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
NSD3Q9BZ95 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
NSD3Q9BZ95 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
NSD3Q9BZ95 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
NSD3Q9BZ95 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
NSD3Q9BZ95 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
NSD3Q9BZ95 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
NSD3Q9BZ95 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
NSD3Q9BZ95 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
NSD3Q9BZ95 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
NSD3Q9BZ95 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
NSD3Q9BZ95 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC27.27■■□□□ 1.96
NSD3Q9BZ95 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
NSD3Q9BZ95 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
NSD3Q9BZ95 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
NSD3Q9BZ95 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
NSD3Q9BZ95 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
NSD3Q9BZ95 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
NSD3Q9BZ95 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
NSD3Q9BZ95 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
NSD3Q9BZ95 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC27.26■■□□□ 1.95
NSD3Q9BZ95 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
NSD3Q9BZ95 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
NSD3Q9BZ95 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
NSD3Q9BZ95 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
NSD3Q9BZ95 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
NSD3Q9BZ95 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
NSD3Q9BZ95 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
NSD3Q9BZ95 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
NSD3Q9BZ95 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
NSD3Q9BZ95 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
NSD3Q9BZ95 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC27.25■■□□□ 1.95
NSD3Q9BZ95 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
NSD3Q9BZ95 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
NSD3Q9BZ95 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
NSD3Q9BZ95 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
NSD3Q9BZ95 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
NSD3Q9BZ95 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
NSD3Q9BZ95 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
NSD3Q9BZ95 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
NSD3Q9BZ95 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
NSD3Q9BZ95 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
NSD3Q9BZ95 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
NSD3Q9BZ95 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
NSD3Q9BZ95 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
NSD3Q9BZ95 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
NSD3Q9BZ95 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
NSD3Q9BZ95 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
NSD3Q9BZ95 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
NSD3Q9BZ95 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
NSD3Q9BZ95 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
NSD3Q9BZ95 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
NSD3Q9BZ95 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
NSD3Q9BZ95 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
NSD3Q9BZ95 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
NSD3Q9BZ95 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
NSD3Q9BZ95 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
NSD3Q9BZ95 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
NSD3Q9BZ95 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
NSD3Q9BZ95 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
NSD3Q9BZ95 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
NSD3Q9BZ95 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.24■■□□□ 1.95
NSD3Q9BZ95 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
NSD3Q9BZ95 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
NSD3Q9BZ95 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
NSD3Q9BZ95 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
NSD3Q9BZ95 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
NSD3Q9BZ95 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
NSD3Q9BZ95 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
NSD3Q9BZ95 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
NSD3Q9BZ95 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
NSD3Q9BZ95 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
NSD3Q9BZ95 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
NSD3Q9BZ95 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
NSD3Q9BZ95 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
NSD3Q9BZ95 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
NSD3Q9BZ95 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
NSD3Q9BZ95 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
NSD3Q9BZ95 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
NSD3Q9BZ95 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
NSD3Q9BZ95 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
NSD3Q9BZ95 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
NSD3Q9BZ95 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
NSD3Q9BZ95 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
NSD3Q9BZ95 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
NSD3Q9BZ95 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC27.22■■□□□ 1.95
NSD3Q9BZ95 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
NSD3Q9BZ95 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
NSD3Q9BZ95 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
NSD3Q9BZ95 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
NSD3Q9BZ95 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
NSD3Q9BZ95 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.2 ms