Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYG3

NIFK, MKI67 FHA domain-interacting nucleolar phosphoprotein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIFKQ9BYG3 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NIFKQ9BYG3 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NIFKQ9BYG3 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NIFKQ9BYG3 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NIFKQ9BYG3 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NIFKQ9BYG3 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NIFKQ9BYG3 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NIFKQ9BYG3 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
NIFKQ9BYG3 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NIFKQ9BYG3 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NIFKQ9BYG3 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NIFKQ9BYG3 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NIFKQ9BYG3 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NIFKQ9BYG3 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NIFKQ9BYG3 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NIFKQ9BYG3 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NIFKQ9BYG3 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NIFKQ9BYG3 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
NIFKQ9BYG3 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NIFKQ9BYG3 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NIFKQ9BYG3 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NIFKQ9BYG3 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NIFKQ9BYG3 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NIFKQ9BYG3 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NIFKQ9BYG3 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NIFKQ9BYG3 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NIFKQ9BYG3 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NIFKQ9BYG3 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NIFKQ9BYG3 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NIFKQ9BYG3 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NIFKQ9BYG3 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NIFKQ9BYG3 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NIFKQ9BYG3 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NIFKQ9BYG3 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NIFKQ9BYG3 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NIFKQ9BYG3 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NIFKQ9BYG3 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NIFKQ9BYG3 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
NIFKQ9BYG3 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NIFKQ9BYG3 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NIFKQ9BYG3 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NIFKQ9BYG3 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NIFKQ9BYG3 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NIFKQ9BYG3 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NIFKQ9BYG3 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NIFKQ9BYG3 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NIFKQ9BYG3 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
NIFKQ9BYG3 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NIFKQ9BYG3 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NIFKQ9BYG3 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NIFKQ9BYG3 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NIFKQ9BYG3 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NIFKQ9BYG3 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NIFKQ9BYG3 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NIFKQ9BYG3 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NIFKQ9BYG3 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NIFKQ9BYG3 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NIFKQ9BYG3 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NIFKQ9BYG3 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NIFKQ9BYG3 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NIFKQ9BYG3 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NIFKQ9BYG3 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
NIFKQ9BYG3 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NIFKQ9BYG3 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NIFKQ9BYG3 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NIFKQ9BYG3 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NIFKQ9BYG3 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NIFKQ9BYG3 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NIFKQ9BYG3 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NIFKQ9BYG3 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NIFKQ9BYG3 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NIFKQ9BYG3 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NIFKQ9BYG3 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
NIFKQ9BYG3 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NIFKQ9BYG3 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NIFKQ9BYG3 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NIFKQ9BYG3 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NIFKQ9BYG3 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NIFKQ9BYG3 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NIFKQ9BYG3 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NIFKQ9BYG3 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NIFKQ9BYG3 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NIFKQ9BYG3 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NIFKQ9BYG3 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NIFKQ9BYG3 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NIFKQ9BYG3 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NIFKQ9BYG3 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
NIFKQ9BYG3 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NIFKQ9BYG3 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NIFKQ9BYG3 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NIFKQ9BYG3 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
NIFKQ9BYG3 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NIFKQ9BYG3 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NIFKQ9BYG3 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NIFKQ9BYG3 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NIFKQ9BYG3 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NIFKQ9BYG3 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NIFKQ9BYG3 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
NIFKQ9BYG3 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NIFKQ9BYG3 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms