Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ16

SPOCK3, Testican-3, humanhuman

Predictions only

Length 436 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPOCK3Q9BQ16 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
SPOCK3Q9BQ16 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SPOCK3Q9BQ16 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SPOCK3Q9BQ16 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SPOCK3Q9BQ16 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SPOCK3Q9BQ16 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SPOCK3Q9BQ16 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
SPOCK3Q9BQ16 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SPOCK3Q9BQ16 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SPOCK3Q9BQ16 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SPOCK3Q9BQ16 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SPOCK3Q9BQ16 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SPOCK3Q9BQ16 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SPOCK3Q9BQ16 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SPOCK3Q9BQ16 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SPOCK3Q9BQ16 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SPOCK3Q9BQ16 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SPOCK3Q9BQ16 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SPOCK3Q9BQ16 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SPOCK3Q9BQ16 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SPOCK3Q9BQ16 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SPOCK3Q9BQ16 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SPOCK3Q9BQ16 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SPOCK3Q9BQ16 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SPOCK3Q9BQ16 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SPOCK3Q9BQ16 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SPOCK3Q9BQ16 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SPOCK3Q9BQ16 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SPOCK3Q9BQ16 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SPOCK3Q9BQ16 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SPOCK3Q9BQ16 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SPOCK3Q9BQ16 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SPOCK3Q9BQ16 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SPOCK3Q9BQ16 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SPOCK3Q9BQ16 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SPOCK3Q9BQ16 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SPOCK3Q9BQ16 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SPOCK3Q9BQ16 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SPOCK3Q9BQ16 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SPOCK3Q9BQ16 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SPOCK3Q9BQ16 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
SPOCK3Q9BQ16 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SPOCK3Q9BQ16 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SPOCK3Q9BQ16 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SPOCK3Q9BQ16 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SPOCK3Q9BQ16 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SPOCK3Q9BQ16 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SPOCK3Q9BQ16 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SPOCK3Q9BQ16 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SPOCK3Q9BQ16 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SPOCK3Q9BQ16 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SPOCK3Q9BQ16 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SPOCK3Q9BQ16 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SPOCK3Q9BQ16 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SPOCK3Q9BQ16 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SPOCK3Q9BQ16 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SPOCK3Q9BQ16 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SPOCK3Q9BQ16 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SPOCK3Q9BQ16 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SPOCK3Q9BQ16 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SPOCK3Q9BQ16 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SPOCK3Q9BQ16 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SPOCK3Q9BQ16 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SPOCK3Q9BQ16 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SPOCK3Q9BQ16 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SPOCK3Q9BQ16 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SPOCK3Q9BQ16 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SPOCK3Q9BQ16 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SPOCK3Q9BQ16 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SPOCK3Q9BQ16 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
SPOCK3Q9BQ16 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SPOCK3Q9BQ16 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SPOCK3Q9BQ16 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
SPOCK3Q9BQ16 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SPOCK3Q9BQ16 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
SPOCK3Q9BQ16 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SPOCK3Q9BQ16 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SPOCK3Q9BQ16 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SPOCK3Q9BQ16 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SPOCK3Q9BQ16 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SPOCK3Q9BQ16 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SPOCK3Q9BQ16 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SPOCK3Q9BQ16 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SPOCK3Q9BQ16 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
SPOCK3Q9BQ16 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SPOCK3Q9BQ16 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SPOCK3Q9BQ16 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SPOCK3Q9BQ16 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SPOCK3Q9BQ16 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SPOCK3Q9BQ16 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SPOCK3Q9BQ16 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SPOCK3Q9BQ16 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SPOCK3Q9BQ16 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SPOCK3Q9BQ16 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SPOCK3Q9BQ16 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SPOCK3Q9BQ16 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SPOCK3Q9BQ16 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
SPOCK3Q9BQ16 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SPOCK3Q9BQ16 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SPOCK3Q9BQ16 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.6 ms