Protein–RNA interactions for Protein: Q99928

GABRG3, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit gamma-3, humanhuman

Predictions only

Length 467 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRG3Q99928 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GABRG3Q99928 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GABRG3Q99928 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GABRG3Q99928 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GABRG3Q99928 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GABRG3Q99928 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GABRG3Q99928 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GABRG3Q99928 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GABRG3Q99928 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GABRG3Q99928 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GABRG3Q99928 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GABRG3Q99928 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GABRG3Q99928 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GABRG3Q99928 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
GABRG3Q99928 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GABRG3Q99928 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GABRG3Q99928 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GABRG3Q99928 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GABRG3Q99928 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GABRG3Q99928 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GABRG3Q99928 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GABRG3Q99928 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GABRG3Q99928 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GABRG3Q99928 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GABRG3Q99928 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GABRG3Q99928 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GABRG3Q99928 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GABRG3Q99928 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GABRG3Q99928 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GABRG3Q99928 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GABRG3Q99928 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GABRG3Q99928 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GABRG3Q99928 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GABRG3Q99928 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GABRG3Q99928 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GABRG3Q99928 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GABRG3Q99928 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GABRG3Q99928 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GABRG3Q99928 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GABRG3Q99928 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
GABRG3Q99928 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GABRG3Q99928 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GABRG3Q99928 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GABRG3Q99928 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GABRG3Q99928 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GABRG3Q99928 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GABRG3Q99928 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GABRG3Q99928 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GABRG3Q99928 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GABRG3Q99928 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GABRG3Q99928 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GABRG3Q99928 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GABRG3Q99928 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GABRG3Q99928 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GABRG3Q99928 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GABRG3Q99928 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
GABRG3Q99928 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
GABRG3Q99928 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GABRG3Q99928 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GABRG3Q99928 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
GABRG3Q99928 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
GABRG3Q99928 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GABRG3Q99928 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GABRG3Q99928 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
GABRG3Q99928 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
GABRG3Q99928 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
GABRG3Q99928 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
GABRG3Q99928 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.81
GABRG3Q99928 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
GABRG3Q99928 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
GABRG3Q99928 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
GABRG3Q99928 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
GABRG3Q99928 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GABRG3Q99928 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GABRG3Q99928 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GABRG3Q99928 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GABRG3Q99928 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GABRG3Q99928 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GABRG3Q99928 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GABRG3Q99928 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
GABRG3Q99928 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GABRG3Q99928 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GABRG3Q99928 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GABRG3Q99928 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GABRG3Q99928 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GABRG3Q99928 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GABRG3Q99928 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
GABRG3Q99928 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
GABRG3Q99928 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
GABRG3Q99928 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GABRG3Q99928 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
GABRG3Q99928 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
GABRG3Q99928 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
GABRG3Q99928 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
GABRG3Q99928 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
GABRG3Q99928 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GABRG3Q99928 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GABRG3Q99928 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GABRG3Q99928 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
GABRG3Q99928 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.9 ms