Protein–RNA interactions for Protein: Q99638

RAD9A, Cell cycle checkpoint control protein RAD9A, humanhuman

Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD9AQ99638 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RAD9AQ99638 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RAD9AQ99638 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RAD9AQ99638 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RAD9AQ99638 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RAD9AQ99638 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RAD9AQ99638 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RAD9AQ99638 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RAD9AQ99638 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RAD9AQ99638 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RAD9AQ99638 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RAD9AQ99638 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RAD9AQ99638 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
RAD9AQ99638 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RAD9AQ99638 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RAD9AQ99638 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RAD9AQ99638 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RAD9AQ99638 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RAD9AQ99638 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RAD9AQ99638 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RAD9AQ99638 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RAD9AQ99638 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RAD9AQ99638 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RAD9AQ99638 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RAD9AQ99638 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RAD9AQ99638 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RAD9AQ99638 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RAD9AQ99638 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
RAD9AQ99638 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RAD9AQ99638 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RAD9AQ99638 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
RAD9AQ99638 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RAD9AQ99638 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RAD9AQ99638 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RAD9AQ99638 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RAD9AQ99638 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RAD9AQ99638 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RAD9AQ99638 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RAD9AQ99638 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RAD9AQ99638 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RAD9AQ99638 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RAD9AQ99638 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RAD9AQ99638 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RAD9AQ99638 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RAD9AQ99638 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RAD9AQ99638 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RAD9AQ99638 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RAD9AQ99638 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RAD9AQ99638 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RAD9AQ99638 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RAD9AQ99638 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RAD9AQ99638 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RAD9AQ99638 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RAD9AQ99638 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RAD9AQ99638 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RAD9AQ99638 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RAD9AQ99638 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RAD9AQ99638 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RAD9AQ99638 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RAD9AQ99638 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RAD9AQ99638 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
RAD9AQ99638 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
RAD9AQ99638 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RAD9AQ99638 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RAD9AQ99638 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RAD9AQ99638 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RAD9AQ99638 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RAD9AQ99638 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RAD9AQ99638 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RAD9AQ99638 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RAD9AQ99638 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RAD9AQ99638 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RAD9AQ99638 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RAD9AQ99638 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RAD9AQ99638 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RAD9AQ99638 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RAD9AQ99638 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RAD9AQ99638 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
RAD9AQ99638 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
RAD9AQ99638 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RAD9AQ99638 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
RAD9AQ99638 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RAD9AQ99638 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
RAD9AQ99638 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RAD9AQ99638 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RAD9AQ99638 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RAD9AQ99638 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RAD9AQ99638 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RAD9AQ99638 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RAD9AQ99638 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RAD9AQ99638 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.03
RAD9AQ99638 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
RAD9AQ99638 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RAD9AQ99638 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RAD9AQ99638 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RAD9AQ99638 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RAD9AQ99638 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RAD9AQ99638 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RAD9AQ99638 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RAD9AQ99638 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41 ms