Protein–RNA interactions for Protein: Q96S38

RPS6KC1, Ribosomal protein S6 kinase delta-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,066 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS6KC1Q96S38 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RPS6KC1Q96S38 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
RPS6KC1Q96S38 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RPS6KC1Q96S38 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RPS6KC1Q96S38 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RPS6KC1Q96S38 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RPS6KC1Q96S38 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RPS6KC1Q96S38 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
RPS6KC1Q96S38 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RPS6KC1Q96S38 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
RPS6KC1Q96S38 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RPS6KC1Q96S38 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
RPS6KC1Q96S38 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
RPS6KC1Q96S38 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
RPS6KC1Q96S38 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
RPS6KC1Q96S38 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RPS6KC1Q96S38 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
RPS6KC1Q96S38 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
RPS6KC1Q96S38 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
RPS6KC1Q96S38 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
RPS6KC1Q96S38 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RPS6KC1Q96S38 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RPS6KC1Q96S38 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RPS6KC1Q96S38 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RPS6KC1Q96S38 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RPS6KC1Q96S38 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RPS6KC1Q96S38 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RPS6KC1Q96S38 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RPS6KC1Q96S38 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RPS6KC1Q96S38 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RPS6KC1Q96S38 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RPS6KC1Q96S38 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RPS6KC1Q96S38 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RPS6KC1Q96S38 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RPS6KC1Q96S38 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
RPS6KC1Q96S38 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RPS6KC1Q96S38 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
RPS6KC1Q96S38 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RPS6KC1Q96S38 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RPS6KC1Q96S38 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RPS6KC1Q96S38 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
RPS6KC1Q96S38 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RPS6KC1Q96S38 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RPS6KC1Q96S38 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RPS6KC1Q96S38 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RPS6KC1Q96S38 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RPS6KC1Q96S38 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RPS6KC1Q96S38 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
RPS6KC1Q96S38 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
RPS6KC1Q96S38 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
RPS6KC1Q96S38 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
RPS6KC1Q96S38 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
RPS6KC1Q96S38 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RPS6KC1Q96S38 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RPS6KC1Q96S38 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
RPS6KC1Q96S38 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
RPS6KC1Q96S38 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
RPS6KC1Q96S38 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
RPS6KC1Q96S38 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
RPS6KC1Q96S38 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RPS6KC1Q96S38 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RPS6KC1Q96S38 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.91■■□□□ 1.1
RPS6KC1Q96S38 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RPS6KC1Q96S38 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RPS6KC1Q96S38 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RPS6KC1Q96S38 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RPS6KC1Q96S38 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RPS6KC1Q96S38 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RPS6KC1Q96S38 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RPS6KC1Q96S38 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RPS6KC1Q96S38 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RPS6KC1Q96S38 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RPS6KC1Q96S38 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RPS6KC1Q96S38 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RPS6KC1Q96S38 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RPS6KC1Q96S38 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RPS6KC1Q96S38 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RPS6KC1Q96S38 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RPS6KC1Q96S38 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RPS6KC1Q96S38 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RPS6KC1Q96S38 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RPS6KC1Q96S38 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RPS6KC1Q96S38 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RPS6KC1Q96S38 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RPS6KC1Q96S38 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RPS6KC1Q96S38 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RPS6KC1Q96S38 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RPS6KC1Q96S38 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
RPS6KC1Q96S38 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
RPS6KC1Q96S38 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.1
RPS6KC1Q96S38 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
RPS6KC1Q96S38 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
RPS6KC1Q96S38 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
RPS6KC1Q96S38 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
RPS6KC1Q96S38 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
RPS6KC1Q96S38 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
RPS6KC1Q96S38 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
RPS6KC1Q96S38 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
RPS6KC1Q96S38 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
RPS6KC1Q96S38 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms