Protein–RNA interactions for Protein: Q96GP6

SCARF2, Scavenger receptor class F member 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 870 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARF2Q96GP6 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
SCARF2Q96GP6 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SCARF2Q96GP6 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SCARF2Q96GP6 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SCARF2Q96GP6 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SCARF2Q96GP6 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SCARF2Q96GP6 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SCARF2Q96GP6 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SCARF2Q96GP6 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SCARF2Q96GP6 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SCARF2Q96GP6 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SCARF2Q96GP6 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SCARF2Q96GP6 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SCARF2Q96GP6 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SCARF2Q96GP6 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SCARF2Q96GP6 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SCARF2Q96GP6 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SCARF2Q96GP6 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SCARF2Q96GP6 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SCARF2Q96GP6 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SCARF2Q96GP6 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
SCARF2Q96GP6 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SCARF2Q96GP6 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SCARF2Q96GP6 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SCARF2Q96GP6 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
SCARF2Q96GP6 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SCARF2Q96GP6 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SCARF2Q96GP6 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SCARF2Q96GP6 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SCARF2Q96GP6 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SCARF2Q96GP6 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
SCARF2Q96GP6 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SCARF2Q96GP6 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SCARF2Q96GP6 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SCARF2Q96GP6 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
SCARF2Q96GP6 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
SCARF2Q96GP6 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SCARF2Q96GP6 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SCARF2Q96GP6 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SCARF2Q96GP6 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SCARF2Q96GP6 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
SCARF2Q96GP6 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SCARF2Q96GP6 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SCARF2Q96GP6 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SCARF2Q96GP6 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SCARF2Q96GP6 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SCARF2Q96GP6 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SCARF2Q96GP6 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC19.52■□□□□ 0.71
SCARF2Q96GP6 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
SCARF2Q96GP6 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
SCARF2Q96GP6 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
SCARF2Q96GP6 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SCARF2Q96GP6 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SCARF2Q96GP6 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SCARF2Q96GP6 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SCARF2Q96GP6 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SCARF2Q96GP6 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
SCARF2Q96GP6 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SCARF2Q96GP6 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
SCARF2Q96GP6 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SCARF2Q96GP6 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SCARF2Q96GP6 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SCARF2Q96GP6 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SCARF2Q96GP6 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SCARF2Q96GP6 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SCARF2Q96GP6 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SCARF2Q96GP6 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SCARF2Q96GP6 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SCARF2Q96GP6 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SCARF2Q96GP6 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SCARF2Q96GP6 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
SCARF2Q96GP6 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SCARF2Q96GP6 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SCARF2Q96GP6 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
SCARF2Q96GP6 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SCARF2Q96GP6 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SCARF2Q96GP6 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SCARF2Q96GP6 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SCARF2Q96GP6 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SCARF2Q96GP6 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SCARF2Q96GP6 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SCARF2Q96GP6 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SCARF2Q96GP6 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SCARF2Q96GP6 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SCARF2Q96GP6 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SCARF2Q96GP6 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SCARF2Q96GP6 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SCARF2Q96GP6 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SCARF2Q96GP6 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SCARF2Q96GP6 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SCARF2Q96GP6 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SCARF2Q96GP6 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SCARF2Q96GP6 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SCARF2Q96GP6 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SCARF2Q96GP6 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
SCARF2Q96GP6 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SCARF2Q96GP6 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SCARF2Q96GP6 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SCARF2Q96GP6 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SCARF2Q96GP6 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms