Protein–RNA interactions for Protein: Q96DT6

ATG4C, Cysteine protease ATG4C, humanhuman

Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4CQ96DT6 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ATG4CQ96DT6 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ATG4CQ96DT6 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ATG4CQ96DT6 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
ATG4CQ96DT6 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ATG4CQ96DT6 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ATG4CQ96DT6 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ATG4CQ96DT6 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ATG4CQ96DT6 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ATG4CQ96DT6 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ATG4CQ96DT6 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ATG4CQ96DT6 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ATG4CQ96DT6 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
ATG4CQ96DT6 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ATG4CQ96DT6 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ATG4CQ96DT6 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ATG4CQ96DT6 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ATG4CQ96DT6 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
ATG4CQ96DT6 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
ATG4CQ96DT6 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ATG4CQ96DT6 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ATG4CQ96DT6 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ATG4CQ96DT6 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ATG4CQ96DT6 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ATG4CQ96DT6 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ATG4CQ96DT6 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ATG4CQ96DT6 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ATG4CQ96DT6 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ATG4CQ96DT6 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ATG4CQ96DT6 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
ATG4CQ96DT6 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ATG4CQ96DT6 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ATG4CQ96DT6 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
ATG4CQ96DT6 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ATG4CQ96DT6 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ATG4CQ96DT6 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ATG4CQ96DT6 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ATG4CQ96DT6 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
ATG4CQ96DT6 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ATG4CQ96DT6 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ATG4CQ96DT6 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ATG4CQ96DT6 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ATG4CQ96DT6 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ATG4CQ96DT6 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ATG4CQ96DT6 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ATG4CQ96DT6 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ATG4CQ96DT6 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ATG4CQ96DT6 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ATG4CQ96DT6 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ATG4CQ96DT6 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ATG4CQ96DT6 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ATG4CQ96DT6 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ATG4CQ96DT6 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ATG4CQ96DT6 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ATG4CQ96DT6 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ATG4CQ96DT6 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ATG4CQ96DT6 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
ATG4CQ96DT6 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ATG4CQ96DT6 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ATG4CQ96DT6 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ATG4CQ96DT6 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ATG4CQ96DT6 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ATG4CQ96DT6 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ATG4CQ96DT6 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ATG4CQ96DT6 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ATG4CQ96DT6 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ATG4CQ96DT6 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ATG4CQ96DT6 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ATG4CQ96DT6 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ATG4CQ96DT6 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ATG4CQ96DT6 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ATG4CQ96DT6 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ATG4CQ96DT6 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ATG4CQ96DT6 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ATG4CQ96DT6 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ATG4CQ96DT6 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ATG4CQ96DT6 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ATG4CQ96DT6 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ATG4CQ96DT6 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ATG4CQ96DT6 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ATG4CQ96DT6 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ATG4CQ96DT6 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC23■■□□□ 1.27
ATG4CQ96DT6 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
ATG4CQ96DT6 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ATG4CQ96DT6 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ATG4CQ96DT6 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ATG4CQ96DT6 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ATG4CQ96DT6 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ATG4CQ96DT6 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
ATG4CQ96DT6 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
ATG4CQ96DT6 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC23■■□□□ 1.27
ATG4CQ96DT6 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC23■■□□□ 1.27
ATG4CQ96DT6 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
ATG4CQ96DT6 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ATG4CQ96DT6 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
ATG4CQ96DT6 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC23■■□□□ 1.27
ATG4CQ96DT6 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
ATG4CQ96DT6 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ATG4CQ96DT6 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC23■■□□□ 1.27
ATG4CQ96DT6 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.7 ms