Protein–RNA interactions for Protein: Q95604

HLA-C, HLA class I histocompatibility antigen, Cw-17 alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-CQ95604 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
HLA-CQ95604 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
HLA-CQ95604 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
HLA-CQ95604 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC20.87■□□□□ 0.93
HLA-CQ95604 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
HLA-CQ95604 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
HLA-CQ95604 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
HLA-CQ95604 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
HLA-CQ95604 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
HLA-CQ95604 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
HLA-CQ95604 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
HLA-CQ95604 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
HLA-CQ95604 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
HLA-CQ95604 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
HLA-CQ95604 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
HLA-CQ95604 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC20.86■□□□□ 0.93
HLA-CQ95604 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
HLA-CQ95604 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
HLA-CQ95604 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
HLA-CQ95604 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
HLA-CQ95604 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
HLA-CQ95604 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
HLA-CQ95604 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
HLA-CQ95604 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
HLA-CQ95604 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
HLA-CQ95604 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
HLA-CQ95604 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
HLA-CQ95604 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
HLA-CQ95604 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
HLA-CQ95604 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
HLA-CQ95604 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
HLA-CQ95604 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
HLA-CQ95604 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
HLA-CQ95604 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
HLA-CQ95604 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
HLA-CQ95604 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
HLA-CQ95604 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
HLA-CQ95604 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
HLA-CQ95604 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
HLA-CQ95604 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
HLA-CQ95604 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
HLA-CQ95604 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
HLA-CQ95604 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
HLA-CQ95604 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
HLA-CQ95604 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
HLA-CQ95604 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
HLA-CQ95604 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
HLA-CQ95604 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
HLA-CQ95604 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
HLA-CQ95604 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
HLA-CQ95604 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
HLA-CQ95604 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
HLA-CQ95604 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
HLA-CQ95604 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
HLA-CQ95604 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
HLA-CQ95604 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
HLA-CQ95604 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
HLA-CQ95604 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC20.84■□□□□ 0.93
HLA-CQ95604 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
HLA-CQ95604 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
HLA-CQ95604 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
HLA-CQ95604 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
HLA-CQ95604 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
HLA-CQ95604 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
HLA-CQ95604 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
HLA-CQ95604 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
HLA-CQ95604 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
HLA-CQ95604 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
HLA-CQ95604 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
HLA-CQ95604 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
HLA-CQ95604 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
HLA-CQ95604 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
HLA-CQ95604 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
HLA-CQ95604 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
HLA-CQ95604 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
HLA-CQ95604 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
HLA-CQ95604 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
HLA-CQ95604 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
HLA-CQ95604 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
HLA-CQ95604 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
HLA-CQ95604 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
HLA-CQ95604 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
HLA-CQ95604 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
HLA-CQ95604 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
HLA-CQ95604 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
HLA-CQ95604 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
HLA-CQ95604 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
HLA-CQ95604 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
HLA-CQ95604 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
HLA-CQ95604 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
HLA-CQ95604 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
HLA-CQ95604 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
HLA-CQ95604 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
HLA-CQ95604 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
HLA-CQ95604 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
HLA-CQ95604 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
HLA-CQ95604 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
HLA-CQ95604 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
HLA-CQ95604 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
HLA-CQ95604 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.1 ms