Protein–RNA interactions for Protein: Q8IZU3

SYCP3, Synaptonemal complex protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP3Q8IZU3 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SYCP3Q8IZU3 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SYCP3Q8IZU3 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SYCP3Q8IZU3 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SYCP3Q8IZU3 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SYCP3Q8IZU3 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SYCP3Q8IZU3 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
SYCP3Q8IZU3 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
SYCP3Q8IZU3 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SYCP3Q8IZU3 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SYCP3Q8IZU3 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SYCP3Q8IZU3 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SYCP3Q8IZU3 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SYCP3Q8IZU3 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SYCP3Q8IZU3 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SYCP3Q8IZU3 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SYCP3Q8IZU3 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
SYCP3Q8IZU3 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SYCP3Q8IZU3 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SYCP3Q8IZU3 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SYCP3Q8IZU3 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SYCP3Q8IZU3 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SYCP3Q8IZU3 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SYCP3Q8IZU3 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SYCP3Q8IZU3 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SYCP3Q8IZU3 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SYCP3Q8IZU3 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SYCP3Q8IZU3 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SYCP3Q8IZU3 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SYCP3Q8IZU3 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SYCP3Q8IZU3 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SYCP3Q8IZU3 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SYCP3Q8IZU3 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SYCP3Q8IZU3 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SYCP3Q8IZU3 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SYCP3Q8IZU3 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SYCP3Q8IZU3 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SYCP3Q8IZU3 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SYCP3Q8IZU3 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SYCP3Q8IZU3 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SYCP3Q8IZU3 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SYCP3Q8IZU3 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SYCP3Q8IZU3 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
SYCP3Q8IZU3 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SYCP3Q8IZU3 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SYCP3Q8IZU3 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SYCP3Q8IZU3 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SYCP3Q8IZU3 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SYCP3Q8IZU3 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SYCP3Q8IZU3 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SYCP3Q8IZU3 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SYCP3Q8IZU3 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SYCP3Q8IZU3 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SYCP3Q8IZU3 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SYCP3Q8IZU3 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SYCP3Q8IZU3 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SYCP3Q8IZU3 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SYCP3Q8IZU3 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SYCP3Q8IZU3 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SYCP3Q8IZU3 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SYCP3Q8IZU3 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SYCP3Q8IZU3 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SYCP3Q8IZU3 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SYCP3Q8IZU3 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SYCP3Q8IZU3 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SYCP3Q8IZU3 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SYCP3Q8IZU3 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SYCP3Q8IZU3 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
SYCP3Q8IZU3 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SYCP3Q8IZU3 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SYCP3Q8IZU3 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SYCP3Q8IZU3 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SYCP3Q8IZU3 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SYCP3Q8IZU3 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SYCP3Q8IZU3 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SYCP3Q8IZU3 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SYCP3Q8IZU3 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SYCP3Q8IZU3 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SYCP3Q8IZU3 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SYCP3Q8IZU3 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SYCP3Q8IZU3 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SYCP3Q8IZU3 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SYCP3Q8IZU3 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SYCP3Q8IZU3 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SYCP3Q8IZU3 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SYCP3Q8IZU3 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SYCP3Q8IZU3 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SYCP3Q8IZU3 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SYCP3Q8IZU3 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SYCP3Q8IZU3 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SYCP3Q8IZU3 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SYCP3Q8IZU3 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SYCP3Q8IZU3 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SYCP3Q8IZU3 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
SYCP3Q8IZU3 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SYCP3Q8IZU3 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
SYCP3Q8IZU3 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SYCP3Q8IZU3 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SYCP3Q8IZU3 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SYCP3Q8IZU3 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms