Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTS3

PTF1A, Pancreas transcription factor 1 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTF1AQ7RTS3 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PTF1AQ7RTS3 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PTF1AQ7RTS3 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PTF1AQ7RTS3 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PTF1AQ7RTS3 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PTF1AQ7RTS3 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PTF1AQ7RTS3 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PTF1AQ7RTS3 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PTF1AQ7RTS3 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PTF1AQ7RTS3 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PTF1AQ7RTS3 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PTF1AQ7RTS3 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PTF1AQ7RTS3 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PTF1AQ7RTS3 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PTF1AQ7RTS3 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PTF1AQ7RTS3 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PTF1AQ7RTS3 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PTF1AQ7RTS3 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PTF1AQ7RTS3 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PTF1AQ7RTS3 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PTF1AQ7RTS3 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
PTF1AQ7RTS3 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PTF1AQ7RTS3 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PTF1AQ7RTS3 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PTF1AQ7RTS3 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PTF1AQ7RTS3 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
PTF1AQ7RTS3 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PTF1AQ7RTS3 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PTF1AQ7RTS3 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PTF1AQ7RTS3 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
PTF1AQ7RTS3 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PTF1AQ7RTS3 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PTF1AQ7RTS3 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PTF1AQ7RTS3 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PTF1AQ7RTS3 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PTF1AQ7RTS3 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PTF1AQ7RTS3 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PTF1AQ7RTS3 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PTF1AQ7RTS3 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PTF1AQ7RTS3 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PTF1AQ7RTS3 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PTF1AQ7RTS3 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PTF1AQ7RTS3 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PTF1AQ7RTS3 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PTF1AQ7RTS3 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PTF1AQ7RTS3 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PTF1AQ7RTS3 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PTF1AQ7RTS3 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PTF1AQ7RTS3 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PTF1AQ7RTS3 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PTF1AQ7RTS3 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
PTF1AQ7RTS3 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PTF1AQ7RTS3 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PTF1AQ7RTS3 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
PTF1AQ7RTS3 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PTF1AQ7RTS3 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PTF1AQ7RTS3 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PTF1AQ7RTS3 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PTF1AQ7RTS3 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PTF1AQ7RTS3 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
PTF1AQ7RTS3 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PTF1AQ7RTS3 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PTF1AQ7RTS3 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC25.9■■□□□ 1.74
PTF1AQ7RTS3 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
PTF1AQ7RTS3 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
PTF1AQ7RTS3 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
PTF1AQ7RTS3 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PTF1AQ7RTS3 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
PTF1AQ7RTS3 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
PTF1AQ7RTS3 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PTF1AQ7RTS3 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC25.9■■□□□ 1.74
PTF1AQ7RTS3 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PTF1AQ7RTS3 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
PTF1AQ7RTS3 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
PTF1AQ7RTS3 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
PTF1AQ7RTS3 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
PTF1AQ7RTS3 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
PTF1AQ7RTS3 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
PTF1AQ7RTS3 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
PTF1AQ7RTS3 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
PTF1AQ7RTS3 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
PTF1AQ7RTS3 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
PTF1AQ7RTS3 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
PTF1AQ7RTS3 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.73
PTF1AQ7RTS3 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
PTF1AQ7RTS3 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PTF1AQ7RTS3 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PTF1AQ7RTS3 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PTF1AQ7RTS3 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PTF1AQ7RTS3 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PTF1AQ7RTS3 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PTF1AQ7RTS3 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PTF1AQ7RTS3 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PTF1AQ7RTS3 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PTF1AQ7RTS3 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PTF1AQ7RTS3 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PTF1AQ7RTS3 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PTF1AQ7RTS3 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
PTF1AQ7RTS3 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PTF1AQ7RTS3 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms