Protein–RNA interactions for Protein: Q6STE5

SMARCD3, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily D member 3, humanhuman

Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCD3Q6STE5 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SMARCD3Q6STE5 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SMARCD3Q6STE5 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SMARCD3Q6STE5 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SMARCD3Q6STE5 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SMARCD3Q6STE5 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SMARCD3Q6STE5 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SMARCD3Q6STE5 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SMARCD3Q6STE5 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SMARCD3Q6STE5 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SMARCD3Q6STE5 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SMARCD3Q6STE5 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SMARCD3Q6STE5 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
SMARCD3Q6STE5 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SMARCD3Q6STE5 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SMARCD3Q6STE5 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SMARCD3Q6STE5 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
SMARCD3Q6STE5 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SMARCD3Q6STE5 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SMARCD3Q6STE5 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SMARCD3Q6STE5 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SMARCD3Q6STE5 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SMARCD3Q6STE5 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SMARCD3Q6STE5 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SMARCD3Q6STE5 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SMARCD3Q6STE5 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SMARCD3Q6STE5 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SMARCD3Q6STE5 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SMARCD3Q6STE5 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SMARCD3Q6STE5 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SMARCD3Q6STE5 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SMARCD3Q6STE5 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SMARCD3Q6STE5 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SMARCD3Q6STE5 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SMARCD3Q6STE5 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
SMARCD3Q6STE5 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SMARCD3Q6STE5 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
SMARCD3Q6STE5 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SMARCD3Q6STE5 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SMARCD3Q6STE5 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SMARCD3Q6STE5 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SMARCD3Q6STE5 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
SMARCD3Q6STE5 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SMARCD3Q6STE5 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SMARCD3Q6STE5 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SMARCD3Q6STE5 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SMARCD3Q6STE5 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
SMARCD3Q6STE5 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SMARCD3Q6STE5 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SMARCD3Q6STE5 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SMARCD3Q6STE5 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SMARCD3Q6STE5 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SMARCD3Q6STE5 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SMARCD3Q6STE5 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SMARCD3Q6STE5 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SMARCD3Q6STE5 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SMARCD3Q6STE5 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SMARCD3Q6STE5 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.5
SMARCD3Q6STE5 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
SMARCD3Q6STE5 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.5
SMARCD3Q6STE5 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
SMARCD3Q6STE5 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SMARCD3Q6STE5 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SMARCD3Q6STE5 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SMARCD3Q6STE5 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SMARCD3Q6STE5 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SMARCD3Q6STE5 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SMARCD3Q6STE5 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
SMARCD3Q6STE5 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SMARCD3Q6STE5 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SMARCD3Q6STE5 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SMARCD3Q6STE5 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
SMARCD3Q6STE5 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SMARCD3Q6STE5 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SMARCD3Q6STE5 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SMARCD3Q6STE5 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SMARCD3Q6STE5 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SMARCD3Q6STE5 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SMARCD3Q6STE5 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SMARCD3Q6STE5 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SMARCD3Q6STE5 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SMARCD3Q6STE5 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SMARCD3Q6STE5 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SMARCD3Q6STE5 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SMARCD3Q6STE5 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SMARCD3Q6STE5 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SMARCD3Q6STE5 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SMARCD3Q6STE5 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SMARCD3Q6STE5 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SMARCD3Q6STE5 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SMARCD3Q6STE5 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SMARCD3Q6STE5 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SMARCD3Q6STE5 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SMARCD3Q6STE5 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SMARCD3Q6STE5 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
SMARCD3Q6STE5 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SMARCD3Q6STE5 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SMARCD3Q6STE5 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SMARCD3Q6STE5 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SMARCD3Q6STE5 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.8 ms