Protein–RNA interactions for Protein: Q6P435

Putative uncharacterized SMG1-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q6P435 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Q6P435 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Q6P435 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Q6P435 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Q6P435 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Q6P435 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Q6P435 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Q6P435 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Q6P435 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Q6P435 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Q6P435 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Q6P435 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Q6P435 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Q6P435 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Q6P435 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Q6P435 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Q6P435 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Q6P435 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Q6P435 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Q6P435 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Q6P435 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Q6P435 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Q6P435 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Q6P435 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Q6P435 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Q6P435 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Q6P435 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
Q6P435 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Q6P435 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Q6P435 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Q6P435 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Q6P435 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Q6P435 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Q6P435 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Q6P435 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Q6P435 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Q6P435 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Q6P435 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Q6P435 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Q6P435 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Q6P435 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Q6P435 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Q6P435 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Q6P435 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Q6P435 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Q6P435 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Q6P435 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Q6P435 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Q6P435 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Q6P435 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Q6P435 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Q6P435 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Q6P435 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Q6P435 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Q6P435 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Q6P435 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Q6P435 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Q6P435 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Q6P435 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Q6P435 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Q6P435 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Q6P435 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Q6P435 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Q6P435 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Q6P435 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Q6P435 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Q6P435 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Q6P435 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Q6P435 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Q6P435 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Q6P435 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Q6P435 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Q6P435 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Q6P435 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Q6P435 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Q6P435 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Q6P435 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Q6P435 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Q6P435 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Q6P435 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Q6P435 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Q6P435 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Q6P435 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Q6P435 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Q6P435 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Q6P435 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Q6P435 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Q6P435 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Q6P435 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Q6P435 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Q6P435 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Q6P435 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Q6P435 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Q6P435 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Q6P435 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Q6P435 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Q6P435 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Q6P435 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Q6P435 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Q6P435 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.6 ms