Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXP0

EFCAB12, EF-hand calcium-binding domain-containing protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 572 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFCAB12Q6NXP0 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
EFCAB12Q6NXP0 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
EFCAB12Q6NXP0 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
EFCAB12Q6NXP0 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
EFCAB12Q6NXP0 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
EFCAB12Q6NXP0 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
EFCAB12Q6NXP0 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
EFCAB12Q6NXP0 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
EFCAB12Q6NXP0 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
EFCAB12Q6NXP0 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
EFCAB12Q6NXP0 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
EFCAB12Q6NXP0 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
EFCAB12Q6NXP0 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
EFCAB12Q6NXP0 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
EFCAB12Q6NXP0 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
EFCAB12Q6NXP0 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
EFCAB12Q6NXP0 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
EFCAB12Q6NXP0 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
EFCAB12Q6NXP0 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
EFCAB12Q6NXP0 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
EFCAB12Q6NXP0 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
EFCAB12Q6NXP0 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
EFCAB12Q6NXP0 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
EFCAB12Q6NXP0 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
EFCAB12Q6NXP0 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
EFCAB12Q6NXP0 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
EFCAB12Q6NXP0 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
EFCAB12Q6NXP0 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
EFCAB12Q6NXP0 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
EFCAB12Q6NXP0 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
EFCAB12Q6NXP0 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
EFCAB12Q6NXP0 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
EFCAB12Q6NXP0 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
EFCAB12Q6NXP0 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
EFCAB12Q6NXP0 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
EFCAB12Q6NXP0 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
EFCAB12Q6NXP0 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
EFCAB12Q6NXP0 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
EFCAB12Q6NXP0 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
EFCAB12Q6NXP0 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
EFCAB12Q6NXP0 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
EFCAB12Q6NXP0 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
EFCAB12Q6NXP0 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
EFCAB12Q6NXP0 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
EFCAB12Q6NXP0 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
EFCAB12Q6NXP0 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
EFCAB12Q6NXP0 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
EFCAB12Q6NXP0 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
EFCAB12Q6NXP0 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
EFCAB12Q6NXP0 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
EFCAB12Q6NXP0 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
EFCAB12Q6NXP0 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
EFCAB12Q6NXP0 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
EFCAB12Q6NXP0 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
EFCAB12Q6NXP0 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
EFCAB12Q6NXP0 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
EFCAB12Q6NXP0 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
EFCAB12Q6NXP0 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
EFCAB12Q6NXP0 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
EFCAB12Q6NXP0 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
EFCAB12Q6NXP0 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
EFCAB12Q6NXP0 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
EFCAB12Q6NXP0 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
EFCAB12Q6NXP0 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
EFCAB12Q6NXP0 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
EFCAB12Q6NXP0 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
EFCAB12Q6NXP0 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
EFCAB12Q6NXP0 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
EFCAB12Q6NXP0 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
EFCAB12Q6NXP0 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
EFCAB12Q6NXP0 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
EFCAB12Q6NXP0 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
EFCAB12Q6NXP0 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
EFCAB12Q6NXP0 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
EFCAB12Q6NXP0 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
EFCAB12Q6NXP0 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
EFCAB12Q6NXP0 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
EFCAB12Q6NXP0 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
EFCAB12Q6NXP0 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
EFCAB12Q6NXP0 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
EFCAB12Q6NXP0 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
EFCAB12Q6NXP0 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
EFCAB12Q6NXP0 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
EFCAB12Q6NXP0 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
EFCAB12Q6NXP0 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
EFCAB12Q6NXP0 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
EFCAB12Q6NXP0 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
EFCAB12Q6NXP0 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
EFCAB12Q6NXP0 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
EFCAB12Q6NXP0 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
EFCAB12Q6NXP0 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
EFCAB12Q6NXP0 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
EFCAB12Q6NXP0 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
EFCAB12Q6NXP0 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
EFCAB12Q6NXP0 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
EFCAB12Q6NXP0 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
EFCAB12Q6NXP0 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
EFCAB12Q6NXP0 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
EFCAB12Q6NXP0 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
EFCAB12Q6NXP0 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms