Protein–RNA interactions for Protein: Q6IBW4

NCAPH2, Condensin-2 complex subunit H2, humanhuman

Predictions only

Length 605 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCAPH2Q6IBW4 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
NCAPH2Q6IBW4 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NCAPH2Q6IBW4 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NCAPH2Q6IBW4 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NCAPH2Q6IBW4 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
NCAPH2Q6IBW4 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
NCAPH2Q6IBW4 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NCAPH2Q6IBW4 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NCAPH2Q6IBW4 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NCAPH2Q6IBW4 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NCAPH2Q6IBW4 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NCAPH2Q6IBW4 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NCAPH2Q6IBW4 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NCAPH2Q6IBW4 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NCAPH2Q6IBW4 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NCAPH2Q6IBW4 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NCAPH2Q6IBW4 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NCAPH2Q6IBW4 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NCAPH2Q6IBW4 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NCAPH2Q6IBW4 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NCAPH2Q6IBW4 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NCAPH2Q6IBW4 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NCAPH2Q6IBW4 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NCAPH2Q6IBW4 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NCAPH2Q6IBW4 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NCAPH2Q6IBW4 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NCAPH2Q6IBW4 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NCAPH2Q6IBW4 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NCAPH2Q6IBW4 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NCAPH2Q6IBW4 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NCAPH2Q6IBW4 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NCAPH2Q6IBW4 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
NCAPH2Q6IBW4 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NCAPH2Q6IBW4 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NCAPH2Q6IBW4 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NCAPH2Q6IBW4 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
NCAPH2Q6IBW4 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NCAPH2Q6IBW4 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NCAPH2Q6IBW4 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NCAPH2Q6IBW4 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NCAPH2Q6IBW4 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NCAPH2Q6IBW4 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NCAPH2Q6IBW4 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NCAPH2Q6IBW4 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NCAPH2Q6IBW4 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NCAPH2Q6IBW4 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NCAPH2Q6IBW4 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NCAPH2Q6IBW4 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NCAPH2Q6IBW4 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NCAPH2Q6IBW4 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NCAPH2Q6IBW4 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NCAPH2Q6IBW4 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NCAPH2Q6IBW4 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NCAPH2Q6IBW4 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NCAPH2Q6IBW4 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NCAPH2Q6IBW4 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NCAPH2Q6IBW4 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NCAPH2Q6IBW4 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NCAPH2Q6IBW4 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NCAPH2Q6IBW4 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NCAPH2Q6IBW4 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NCAPH2Q6IBW4 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NCAPH2Q6IBW4 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NCAPH2Q6IBW4 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NCAPH2Q6IBW4 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NCAPH2Q6IBW4 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NCAPH2Q6IBW4 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NCAPH2Q6IBW4 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
NCAPH2Q6IBW4 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NCAPH2Q6IBW4 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NCAPH2Q6IBW4 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NCAPH2Q6IBW4 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NCAPH2Q6IBW4 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
NCAPH2Q6IBW4 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NCAPH2Q6IBW4 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NCAPH2Q6IBW4 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NCAPH2Q6IBW4 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NCAPH2Q6IBW4 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NCAPH2Q6IBW4 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NCAPH2Q6IBW4 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NCAPH2Q6IBW4 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NCAPH2Q6IBW4 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NCAPH2Q6IBW4 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NCAPH2Q6IBW4 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
NCAPH2Q6IBW4 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NCAPH2Q6IBW4 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NCAPH2Q6IBW4 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NCAPH2Q6IBW4 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NCAPH2Q6IBW4 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NCAPH2Q6IBW4 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NCAPH2Q6IBW4 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NCAPH2Q6IBW4 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NCAPH2Q6IBW4 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NCAPH2Q6IBW4 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NCAPH2Q6IBW4 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NCAPH2Q6IBW4 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NCAPH2Q6IBW4 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NCAPH2Q6IBW4 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NCAPH2Q6IBW4 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NCAPH2Q6IBW4 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.1 ms