Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTD9

GFI1B, Zinc finger protein Gfi-1b, humanhuman

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Length 330 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GFI1BQ5VTD9 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GFI1BQ5VTD9 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GFI1BQ5VTD9 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GFI1BQ5VTD9 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GFI1BQ5VTD9 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GFI1BQ5VTD9 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GFI1BQ5VTD9 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GFI1BQ5VTD9 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GFI1BQ5VTD9 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GFI1BQ5VTD9 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GFI1BQ5VTD9 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GFI1BQ5VTD9 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GFI1BQ5VTD9 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GFI1BQ5VTD9 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GFI1BQ5VTD9 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GFI1BQ5VTD9 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GFI1BQ5VTD9 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
GFI1BQ5VTD9 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GFI1BQ5VTD9 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GFI1BQ5VTD9 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GFI1BQ5VTD9 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GFI1BQ5VTD9 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GFI1BQ5VTD9 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GFI1BQ5VTD9 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GFI1BQ5VTD9 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GFI1BQ5VTD9 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GFI1BQ5VTD9 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GFI1BQ5VTD9 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GFI1BQ5VTD9 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GFI1BQ5VTD9 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GFI1BQ5VTD9 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GFI1BQ5VTD9 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GFI1BQ5VTD9 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GFI1BQ5VTD9 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GFI1BQ5VTD9 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GFI1BQ5VTD9 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GFI1BQ5VTD9 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GFI1BQ5VTD9 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GFI1BQ5VTD9 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GFI1BQ5VTD9 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GFI1BQ5VTD9 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GFI1BQ5VTD9 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
GFI1BQ5VTD9 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GFI1BQ5VTD9 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GFI1BQ5VTD9 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GFI1BQ5VTD9 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GFI1BQ5VTD9 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GFI1BQ5VTD9 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GFI1BQ5VTD9 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GFI1BQ5VTD9 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GFI1BQ5VTD9 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GFI1BQ5VTD9 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GFI1BQ5VTD9 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GFI1BQ5VTD9 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GFI1BQ5VTD9 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GFI1BQ5VTD9 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GFI1BQ5VTD9 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GFI1BQ5VTD9 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GFI1BQ5VTD9 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GFI1BQ5VTD9 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GFI1BQ5VTD9 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GFI1BQ5VTD9 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GFI1BQ5VTD9 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GFI1BQ5VTD9 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GFI1BQ5VTD9 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GFI1BQ5VTD9 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GFI1BQ5VTD9 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GFI1BQ5VTD9 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GFI1BQ5VTD9 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GFI1BQ5VTD9 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GFI1BQ5VTD9 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GFI1BQ5VTD9 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
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GFI1BQ5VTD9 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
GFI1BQ5VTD9 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
GFI1BQ5VTD9 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GFI1BQ5VTD9 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GFI1BQ5VTD9 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GFI1BQ5VTD9 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GFI1BQ5VTD9 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GFI1BQ5VTD9 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GFI1BQ5VTD9 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GFI1BQ5VTD9 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GFI1BQ5VTD9 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GFI1BQ5VTD9 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GFI1BQ5VTD9 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GFI1BQ5VTD9 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GFI1BQ5VTD9 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GFI1BQ5VTD9 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GFI1BQ5VTD9 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GFI1BQ5VTD9 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GFI1BQ5VTD9 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GFI1BQ5VTD9 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GFI1BQ5VTD9 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GFI1BQ5VTD9 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
GFI1BQ5VTD9 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GFI1BQ5VTD9 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GFI1BQ5VTD9 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GFI1BQ5VTD9 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GFI1BQ5VTD9 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
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