Protein–RNA interactions for Protein: Q5JVF3

PCID2, PCI domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 399 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCID2Q5JVF3 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PCID2Q5JVF3 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PCID2Q5JVF3 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PCID2Q5JVF3 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PCID2Q5JVF3 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PCID2Q5JVF3 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PCID2Q5JVF3 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PCID2Q5JVF3 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PCID2Q5JVF3 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PCID2Q5JVF3 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PCID2Q5JVF3 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PCID2Q5JVF3 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PCID2Q5JVF3 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PCID2Q5JVF3 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
PCID2Q5JVF3 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
PCID2Q5JVF3 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
PCID2Q5JVF3 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PCID2Q5JVF3 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PCID2Q5JVF3 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PCID2Q5JVF3 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
PCID2Q5JVF3 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PCID2Q5JVF3 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PCID2Q5JVF3 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PCID2Q5JVF3 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
PCID2Q5JVF3 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PCID2Q5JVF3 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PCID2Q5JVF3 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PCID2Q5JVF3 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PCID2Q5JVF3 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PCID2Q5JVF3 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
PCID2Q5JVF3 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PCID2Q5JVF3 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
PCID2Q5JVF3 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PCID2Q5JVF3 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PCID2Q5JVF3 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PCID2Q5JVF3 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PCID2Q5JVF3 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PCID2Q5JVF3 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PCID2Q5JVF3 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PCID2Q5JVF3 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PCID2Q5JVF3 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PCID2Q5JVF3 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
PCID2Q5JVF3 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PCID2Q5JVF3 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PCID2Q5JVF3 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PCID2Q5JVF3 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PCID2Q5JVF3 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PCID2Q5JVF3 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PCID2Q5JVF3 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
PCID2Q5JVF3 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PCID2Q5JVF3 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PCID2Q5JVF3 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PCID2Q5JVF3 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PCID2Q5JVF3 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PCID2Q5JVF3 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PCID2Q5JVF3 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PCID2Q5JVF3 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PCID2Q5JVF3 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PCID2Q5JVF3 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PCID2Q5JVF3 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PCID2Q5JVF3 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PCID2Q5JVF3 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PCID2Q5JVF3 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PCID2Q5JVF3 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PCID2Q5JVF3 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PCID2Q5JVF3 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PCID2Q5JVF3 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PCID2Q5JVF3 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PCID2Q5JVF3 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PCID2Q5JVF3 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PCID2Q5JVF3 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PCID2Q5JVF3 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PCID2Q5JVF3 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PCID2Q5JVF3 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PCID2Q5JVF3 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PCID2Q5JVF3 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PCID2Q5JVF3 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
PCID2Q5JVF3 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PCID2Q5JVF3 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PCID2Q5JVF3 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PCID2Q5JVF3 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PCID2Q5JVF3 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PCID2Q5JVF3 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PCID2Q5JVF3 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
PCID2Q5JVF3 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PCID2Q5JVF3 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PCID2Q5JVF3 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PCID2Q5JVF3 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PCID2Q5JVF3 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PCID2Q5JVF3 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PCID2Q5JVF3 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PCID2Q5JVF3 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PCID2Q5JVF3 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PCID2Q5JVF3 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PCID2Q5JVF3 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PCID2Q5JVF3 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PCID2Q5JVF3 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PCID2Q5JVF3 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
PCID2Q5JVF3 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PCID2Q5JVF3 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15 ms