Protein–RNA interactions for Protein: Q53GT1

KLHL22, Kelch-like protein 22, humanhuman

Predictions only

Length 634 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL22Q53GT1 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
KLHL22Q53GT1 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
KLHL22Q53GT1 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
KLHL22Q53GT1 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
KLHL22Q53GT1 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
KLHL22Q53GT1 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
KLHL22Q53GT1 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
KLHL22Q53GT1 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
KLHL22Q53GT1 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
KLHL22Q53GT1 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
KLHL22Q53GT1 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
KLHL22Q53GT1 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
KLHL22Q53GT1 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
KLHL22Q53GT1 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
KLHL22Q53GT1 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
KLHL22Q53GT1 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
KLHL22Q53GT1 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
KLHL22Q53GT1 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
KLHL22Q53GT1 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
KLHL22Q53GT1 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
KLHL22Q53GT1 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
KLHL22Q53GT1 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
KLHL22Q53GT1 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
KLHL22Q53GT1 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
KLHL22Q53GT1 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
KLHL22Q53GT1 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
KLHL22Q53GT1 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
KLHL22Q53GT1 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
KLHL22Q53GT1 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
KLHL22Q53GT1 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
KLHL22Q53GT1 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
KLHL22Q53GT1 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
KLHL22Q53GT1 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
KLHL22Q53GT1 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
KLHL22Q53GT1 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
KLHL22Q53GT1 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
KLHL22Q53GT1 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
KLHL22Q53GT1 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
KLHL22Q53GT1 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
KLHL22Q53GT1 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
KLHL22Q53GT1 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
KLHL22Q53GT1 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
KLHL22Q53GT1 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
KLHL22Q53GT1 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
KLHL22Q53GT1 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
KLHL22Q53GT1 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
KLHL22Q53GT1 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC18■□□□□ 0.47
KLHL22Q53GT1 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
KLHL22Q53GT1 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
KLHL22Q53GT1 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC18■□□□□ 0.47
KLHL22Q53GT1 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
KLHL22Q53GT1 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
KLHL22Q53GT1 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
KLHL22Q53GT1 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
KLHL22Q53GT1 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
KLHL22Q53GT1 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
KLHL22Q53GT1 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
KLHL22Q53GT1 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
KLHL22Q53GT1 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
KLHL22Q53GT1 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
KLHL22Q53GT1 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
KLHL22Q53GT1 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
KLHL22Q53GT1 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
KLHL22Q53GT1 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
KLHL22Q53GT1 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
KLHL22Q53GT1 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
KLHL22Q53GT1 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
KLHL22Q53GT1 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
KLHL22Q53GT1 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
KLHL22Q53GT1 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
KLHL22Q53GT1 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
KLHL22Q53GT1 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
KLHL22Q53GT1 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
KLHL22Q53GT1 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
KLHL22Q53GT1 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
KLHL22Q53GT1 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
KLHL22Q53GT1 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
KLHL22Q53GT1 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
KLHL22Q53GT1 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
KLHL22Q53GT1 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
KLHL22Q53GT1 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
KLHL22Q53GT1 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
KLHL22Q53GT1 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
KLHL22Q53GT1 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
KLHL22Q53GT1 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
KLHL22Q53GT1 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
KLHL22Q53GT1 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
KLHL22Q53GT1 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
KLHL22Q53GT1 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
KLHL22Q53GT1 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
KLHL22Q53GT1 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
KLHL22Q53GT1 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
KLHL22Q53GT1 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
KLHL22Q53GT1 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
KLHL22Q53GT1 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
KLHL22Q53GT1 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
KLHL22Q53GT1 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
KLHL22Q53GT1 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
KLHL22Q53GT1 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
KLHL22Q53GT1 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.9 ms