Protein–RNA interactions for Protein: Q3UYG1

Ccdc160, Coiled-coil domain-containing protein 160, mousemouse

Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc160Q3UYG1 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc160Q3UYG1 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc160Q3UYG1 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc160Q3UYG1 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc160Q3UYG1 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc160Q3UYG1 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc160Q3UYG1 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc160Q3UYG1 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc160Q3UYG1 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc160Q3UYG1 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc160Q3UYG1 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc160Q3UYG1 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc160Q3UYG1 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc160Q3UYG1 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc160Q3UYG1 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc160Q3UYG1 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc160Q3UYG1 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc160Q3UYG1 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc160Q3UYG1 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc160Q3UYG1 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc160Q3UYG1 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc160Q3UYG1 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc160Q3UYG1 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc160Q3UYG1 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc160Q3UYG1 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc160Q3UYG1 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc160Q3UYG1 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc160Q3UYG1 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc160Q3UYG1 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc160Q3UYG1 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc160Q3UYG1 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc160Q3UYG1 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc160Q3UYG1 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc160Q3UYG1 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc160Q3UYG1 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc160Q3UYG1 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc160Q3UYG1 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc160Q3UYG1 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc160Q3UYG1 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc160Q3UYG1 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc160Q3UYG1 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc160Q3UYG1 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc160Q3UYG1 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc160Q3UYG1 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc160Q3UYG1 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc160Q3UYG1 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc160Q3UYG1 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc160Q3UYG1 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc160Q3UYG1 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc160Q3UYG1 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc160Q3UYG1 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc160Q3UYG1 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc160Q3UYG1 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc160Q3UYG1 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc160Q3UYG1 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc160Q3UYG1 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc160Q3UYG1 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc160Q3UYG1 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc160Q3UYG1 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc160Q3UYG1 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc160Q3UYG1 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc160Q3UYG1 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc160Q3UYG1 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc160Q3UYG1 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc160Q3UYG1 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc160Q3UYG1 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc160Q3UYG1 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc160Q3UYG1 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc160Q3UYG1 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc160Q3UYG1 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc160Q3UYG1 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc160Q3UYG1 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc160Q3UYG1 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc160Q3UYG1 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc160Q3UYG1 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc160Q3UYG1 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc160Q3UYG1 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc160Q3UYG1 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc160Q3UYG1 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc160Q3UYG1 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc160Q3UYG1 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc160Q3UYG1 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc160Q3UYG1 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc160Q3UYG1 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc160Q3UYG1 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc160Q3UYG1 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc160Q3UYG1 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Ccdc160Q3UYG1 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Ccdc160Q3UYG1 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Ccdc160Q3UYG1 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Ccdc160Q3UYG1 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccdc160Q3UYG1 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccdc160Q3UYG1 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccdc160Q3UYG1 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccdc160Q3UYG1 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccdc160Q3UYG1 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccdc160Q3UYG1 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccdc160Q3UYG1 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccdc160Q3UYG1 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccdc160Q3UYG1 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms