Protein–RNA interactions for Protein: Q16831

UPP1, Uridine phosphorylase 1, humanhuman

Predictions only

Length 310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPP1Q16831 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
UPP1Q16831 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
UPP1Q16831 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
UPP1Q16831 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
UPP1Q16831 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
UPP1Q16831 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
UPP1Q16831 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
UPP1Q16831 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
UPP1Q16831 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
UPP1Q16831 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
UPP1Q16831 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
UPP1Q16831 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
UPP1Q16831 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
UPP1Q16831 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
UPP1Q16831 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
UPP1Q16831 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
UPP1Q16831 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
UPP1Q16831 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
UPP1Q16831 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
UPP1Q16831 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
UPP1Q16831 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
UPP1Q16831 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
UPP1Q16831 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
UPP1Q16831 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.02
UPP1Q16831 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
UPP1Q16831 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
UPP1Q16831 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
UPP1Q16831 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
UPP1Q16831 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
UPP1Q16831 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
UPP1Q16831 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
UPP1Q16831 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
UPP1Q16831 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
UPP1Q16831 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
UPP1Q16831 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
UPP1Q16831 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
UPP1Q16831 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
UPP1Q16831 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
UPP1Q16831 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
UPP1Q16831 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
UPP1Q16831 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
UPP1Q16831 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
UPP1Q16831 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
UPP1Q16831 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
UPP1Q16831 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
UPP1Q16831 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
UPP1Q16831 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
UPP1Q16831 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
UPP1Q16831 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
UPP1Q16831 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
UPP1Q16831 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
UPP1Q16831 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
UPP1Q16831 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
UPP1Q16831 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
UPP1Q16831 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
UPP1Q16831 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
UPP1Q16831 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
UPP1Q16831 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
UPP1Q16831 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
UPP1Q16831 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
UPP1Q16831 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
UPP1Q16831 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
UPP1Q16831 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
UPP1Q16831 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
UPP1Q16831 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
UPP1Q16831 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
UPP1Q16831 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
UPP1Q16831 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
UPP1Q16831 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
UPP1Q16831 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
UPP1Q16831 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
UPP1Q16831 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
UPP1Q16831 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
UPP1Q16831 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
UPP1Q16831 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
UPP1Q16831 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
UPP1Q16831 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
UPP1Q16831 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
UPP1Q16831 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
UPP1Q16831 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
UPP1Q16831 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
UPP1Q16831 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
UPP1Q16831 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
UPP1Q16831 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
UPP1Q16831 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
UPP1Q16831 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
UPP1Q16831 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
UPP1Q16831 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
UPP1Q16831 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
UPP1Q16831 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
UPP1Q16831 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
UPP1Q16831 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
UPP1Q16831 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
UPP1Q16831 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
UPP1Q16831 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
UPP1Q16831 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
UPP1Q16831 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
UPP1Q16831 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
UPP1Q16831 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
UPP1Q16831 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms