Protein–RNA interactions for Protein: Q15651

HMGN3, High mobility group nucleosome-binding domain-containing protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGN3Q15651 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
HMGN3Q15651 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
HMGN3Q15651 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
HMGN3Q15651 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
HMGN3Q15651 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
HMGN3Q15651 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
HMGN3Q15651 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
HMGN3Q15651 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
HMGN3Q15651 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
HMGN3Q15651 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
HMGN3Q15651 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
HMGN3Q15651 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
HMGN3Q15651 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
HMGN3Q15651 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
HMGN3Q15651 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
HMGN3Q15651 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
HMGN3Q15651 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
HMGN3Q15651 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
HMGN3Q15651 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
HMGN3Q15651 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
HMGN3Q15651 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
HMGN3Q15651 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
HMGN3Q15651 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
HMGN3Q15651 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
HMGN3Q15651 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
HMGN3Q15651 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
HMGN3Q15651 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
HMGN3Q15651 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
HMGN3Q15651 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
HMGN3Q15651 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
HMGN3Q15651 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
HMGN3Q15651 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
HMGN3Q15651 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HMGN3Q15651 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HMGN3Q15651 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HMGN3Q15651 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
HMGN3Q15651 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HMGN3Q15651 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HMGN3Q15651 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
HMGN3Q15651 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HMGN3Q15651 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HMGN3Q15651 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
HMGN3Q15651 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
HMGN3Q15651 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HMGN3Q15651 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
HMGN3Q15651 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HMGN3Q15651 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HMGN3Q15651 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HMGN3Q15651 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HMGN3Q15651 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
HMGN3Q15651 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HMGN3Q15651 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HMGN3Q15651 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HMGN3Q15651 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
HMGN3Q15651 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
HMGN3Q15651 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
HMGN3Q15651 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
HMGN3Q15651 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
HMGN3Q15651 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
HMGN3Q15651 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
HMGN3Q15651 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
HMGN3Q15651 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
HMGN3Q15651 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
HMGN3Q15651 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
HMGN3Q15651 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
HMGN3Q15651 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
HMGN3Q15651 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
HMGN3Q15651 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
HMGN3Q15651 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
HMGN3Q15651 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
HMGN3Q15651 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
HMGN3Q15651 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
HMGN3Q15651 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
HMGN3Q15651 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
HMGN3Q15651 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
HMGN3Q15651 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
HMGN3Q15651 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
HMGN3Q15651 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
HMGN3Q15651 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
HMGN3Q15651 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
HMGN3Q15651 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
HMGN3Q15651 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
HMGN3Q15651 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
HMGN3Q15651 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
HMGN3Q15651 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
HMGN3Q15651 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
HMGN3Q15651 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
HMGN3Q15651 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
HMGN3Q15651 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
HMGN3Q15651 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
HMGN3Q15651 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
HMGN3Q15651 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
HMGN3Q15651 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
HMGN3Q15651 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
HMGN3Q15651 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
HMGN3Q15651 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
HMGN3Q15651 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
HMGN3Q15651 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
HMGN3Q15651 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
HMGN3Q15651 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
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