Protein–RNA interactions for Protein: Q15573

TAF1A, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF1AQ15573 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TAF1AQ15573 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TAF1AQ15573 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TAF1AQ15573 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TAF1AQ15573 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
TAF1AQ15573 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TAF1AQ15573 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TAF1AQ15573 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TAF1AQ15573 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TAF1AQ15573 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
TAF1AQ15573 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TAF1AQ15573 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TAF1AQ15573 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TAF1AQ15573 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TAF1AQ15573 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TAF1AQ15573 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TAF1AQ15573 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TAF1AQ15573 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TAF1AQ15573 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TAF1AQ15573 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TAF1AQ15573 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TAF1AQ15573 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TAF1AQ15573 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TAF1AQ15573 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TAF1AQ15573 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TAF1AQ15573 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TAF1AQ15573 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TAF1AQ15573 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TAF1AQ15573 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TAF1AQ15573 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TAF1AQ15573 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TAF1AQ15573 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TAF1AQ15573 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TAF1AQ15573 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
TAF1AQ15573 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TAF1AQ15573 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TAF1AQ15573 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TAF1AQ15573 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TAF1AQ15573 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TAF1AQ15573 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TAF1AQ15573 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TAF1AQ15573 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TAF1AQ15573 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TAF1AQ15573 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TAF1AQ15573 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TAF1AQ15573 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TAF1AQ15573 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
TAF1AQ15573 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TAF1AQ15573 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TAF1AQ15573 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TAF1AQ15573 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TAF1AQ15573 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
TAF1AQ15573 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
TAF1AQ15573 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TAF1AQ15573 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
TAF1AQ15573 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TAF1AQ15573 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TAF1AQ15573 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TAF1AQ15573 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TAF1AQ15573 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
TAF1AQ15573 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
TAF1AQ15573 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
TAF1AQ15573 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
TAF1AQ15573 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
TAF1AQ15573 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
TAF1AQ15573 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
TAF1AQ15573 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TAF1AQ15573 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TAF1AQ15573 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TAF1AQ15573 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TAF1AQ15573 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TAF1AQ15573 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TAF1AQ15573 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TAF1AQ15573 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TAF1AQ15573 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TAF1AQ15573 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TAF1AQ15573 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TAF1AQ15573 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TAF1AQ15573 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TAF1AQ15573 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TAF1AQ15573 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TAF1AQ15573 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
TAF1AQ15573 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TAF1AQ15573 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TAF1AQ15573 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TAF1AQ15573 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TAF1AQ15573 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TAF1AQ15573 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TAF1AQ15573 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TAF1AQ15573 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TAF1AQ15573 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TAF1AQ15573 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
TAF1AQ15573 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TAF1AQ15573 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TAF1AQ15573 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TAF1AQ15573 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TAF1AQ15573 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
TAF1AQ15573 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
TAF1AQ15573 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TAF1AQ15573 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
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