Protein–RNA interactions for Protein: Q15393

SF3B3, Splicing factor 3B subunit 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,217 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3B3Q15393 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SF3B3Q15393 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SF3B3Q15393 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SF3B3Q15393 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SF3B3Q15393 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SF3B3Q15393 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SF3B3Q15393 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SF3B3Q15393 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SF3B3Q15393 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SF3B3Q15393 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SF3B3Q15393 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SF3B3Q15393 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SF3B3Q15393 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SF3B3Q15393 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SF3B3Q15393 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SF3B3Q15393 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SF3B3Q15393 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SF3B3Q15393 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SF3B3Q15393 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SF3B3Q15393 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
SF3B3Q15393 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SF3B3Q15393 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SF3B3Q15393 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SF3B3Q15393 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SF3B3Q15393 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SF3B3Q15393 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SF3B3Q15393 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SF3B3Q15393 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SF3B3Q15393 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SF3B3Q15393 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SF3B3Q15393 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SF3B3Q15393 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
SF3B3Q15393 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SF3B3Q15393 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SF3B3Q15393 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SF3B3Q15393 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SF3B3Q15393 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SF3B3Q15393 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SF3B3Q15393 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SF3B3Q15393 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SF3B3Q15393 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SF3B3Q15393 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
SF3B3Q15393 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
SF3B3Q15393 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
SF3B3Q15393 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SF3B3Q15393 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SF3B3Q15393 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SF3B3Q15393 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SF3B3Q15393 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SF3B3Q15393 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SF3B3Q15393 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SF3B3Q15393 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SF3B3Q15393 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SF3B3Q15393 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SF3B3Q15393 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SF3B3Q15393 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SF3B3Q15393 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SF3B3Q15393 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SF3B3Q15393 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SF3B3Q15393 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SF3B3Q15393 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SF3B3Q15393 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SF3B3Q15393 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SF3B3Q15393 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SF3B3Q15393 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SF3B3Q15393 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SF3B3Q15393 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
SF3B3Q15393 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SF3B3Q15393 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
SF3B3Q15393 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SF3B3Q15393 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SF3B3Q15393 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SF3B3Q15393 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SF3B3Q15393 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SF3B3Q15393 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SF3B3Q15393 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SF3B3Q15393 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SF3B3Q15393 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SF3B3Q15393 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SF3B3Q15393 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SF3B3Q15393 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SF3B3Q15393 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SF3B3Q15393 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SF3B3Q15393 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SF3B3Q15393 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SF3B3Q15393 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SF3B3Q15393 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SF3B3Q15393 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SF3B3Q15393 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SF3B3Q15393 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SF3B3Q15393 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SF3B3Q15393 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SF3B3Q15393 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SF3B3Q15393 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.55
SF3B3Q15393 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC24.7■■□□□ 1.55
SF3B3Q15393 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.55
SF3B3Q15393 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SF3B3Q15393 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SF3B3Q15393 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
SF3B3Q15393 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
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