Protein–RNA interactions for Protein: Q15118

PDK1, [Pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring)] kinase isozyme 1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 436 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDK1Q15118 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PDK1Q15118 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PDK1Q15118 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PDK1Q15118 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PDK1Q15118 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PDK1Q15118 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PDK1Q15118 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PDK1Q15118 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PDK1Q15118 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PDK1Q15118 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PDK1Q15118 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PDK1Q15118 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PDK1Q15118 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PDK1Q15118 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PDK1Q15118 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PDK1Q15118 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PDK1Q15118 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PDK1Q15118 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PDK1Q15118 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PDK1Q15118 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PDK1Q15118 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
PDK1Q15118 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
PDK1Q15118 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
PDK1Q15118 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
PDK1Q15118 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
PDK1Q15118 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
PDK1Q15118 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
PDK1Q15118 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PDK1Q15118 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PDK1Q15118 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PDK1Q15118 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PDK1Q15118 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PDK1Q15118 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PDK1Q15118 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PDK1Q15118 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PDK1Q15118 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PDK1Q15118 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
PDK1Q15118 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PDK1Q15118 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PDK1Q15118 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PDK1Q15118 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
PDK1Q15118 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PDK1Q15118 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PDK1Q15118 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PDK1Q15118 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PDK1Q15118 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PDK1Q15118 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PDK1Q15118 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PDK1Q15118 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PDK1Q15118 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PDK1Q15118 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
PDK1Q15118 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PDK1Q15118 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PDK1Q15118 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PDK1Q15118 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PDK1Q15118 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PDK1Q15118 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
PDK1Q15118 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
PDK1Q15118 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PDK1Q15118 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PDK1Q15118 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PDK1Q15118 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PDK1Q15118 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PDK1Q15118 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PDK1Q15118 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PDK1Q15118 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PDK1Q15118 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PDK1Q15118 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PDK1Q15118 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PDK1Q15118 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
PDK1Q15118 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PDK1Q15118 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PDK1Q15118 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
PDK1Q15118 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
PDK1Q15118 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PDK1Q15118 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PDK1Q15118 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PDK1Q15118 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PDK1Q15118 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PDK1Q15118 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PDK1Q15118 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PDK1Q15118 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PDK1Q15118 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PDK1Q15118 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PDK1Q15118 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PDK1Q15118 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PDK1Q15118 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PDK1Q15118 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PDK1Q15118 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PDK1Q15118 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PDK1Q15118 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PDK1Q15118 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PDK1Q15118 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PDK1Q15118 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
PDK1Q15118 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PDK1Q15118 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
PDK1Q15118 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PDK1Q15118 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PDK1Q15118 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PDK1Q15118 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms