Protein–RNA interactions for Protein: Q15024

EXOSC7, Exosome complex component RRP42, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXOSC7Q15024 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
EXOSC7Q15024 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
EXOSC7Q15024 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
EXOSC7Q15024 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC18.71■□□□□ 0.59
EXOSC7Q15024 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
EXOSC7Q15024 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
EXOSC7Q15024 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
EXOSC7Q15024 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
EXOSC7Q15024 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
EXOSC7Q15024 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
EXOSC7Q15024 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
EXOSC7Q15024 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
EXOSC7Q15024 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
EXOSC7Q15024 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
EXOSC7Q15024 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
EXOSC7Q15024 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
EXOSC7Q15024 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
EXOSC7Q15024 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
EXOSC7Q15024 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
EXOSC7Q15024 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
EXOSC7Q15024 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
EXOSC7Q15024 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
EXOSC7Q15024 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
EXOSC7Q15024 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
EXOSC7Q15024 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
EXOSC7Q15024 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
EXOSC7Q15024 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
EXOSC7Q15024 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
EXOSC7Q15024 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
EXOSC7Q15024 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
EXOSC7Q15024 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
EXOSC7Q15024 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
EXOSC7Q15024 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
EXOSC7Q15024 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
EXOSC7Q15024 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
EXOSC7Q15024 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
EXOSC7Q15024 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
EXOSC7Q15024 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
EXOSC7Q15024 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
EXOSC7Q15024 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
EXOSC7Q15024 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
EXOSC7Q15024 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
EXOSC7Q15024 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
EXOSC7Q15024 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
EXOSC7Q15024 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
EXOSC7Q15024 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
EXOSC7Q15024 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
EXOSC7Q15024 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
EXOSC7Q15024 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
EXOSC7Q15024 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
EXOSC7Q15024 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
EXOSC7Q15024 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
EXOSC7Q15024 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
EXOSC7Q15024 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
EXOSC7Q15024 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
EXOSC7Q15024 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
EXOSC7Q15024 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
EXOSC7Q15024 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
EXOSC7Q15024 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
EXOSC7Q15024 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
EXOSC7Q15024 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
EXOSC7Q15024 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
EXOSC7Q15024 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
EXOSC7Q15024 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
EXOSC7Q15024 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
EXOSC7Q15024 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
EXOSC7Q15024 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
EXOSC7Q15024 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
EXOSC7Q15024 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
EXOSC7Q15024 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
EXOSC7Q15024 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
EXOSC7Q15024 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
EXOSC7Q15024 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
EXOSC7Q15024 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
EXOSC7Q15024 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
EXOSC7Q15024 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
EXOSC7Q15024 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
EXOSC7Q15024 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
EXOSC7Q15024 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
EXOSC7Q15024 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
EXOSC7Q15024 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
EXOSC7Q15024 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
EXOSC7Q15024 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
EXOSC7Q15024 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
EXOSC7Q15024 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
EXOSC7Q15024 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
EXOSC7Q15024 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
EXOSC7Q15024 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
EXOSC7Q15024 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
EXOSC7Q15024 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC18.67■□□□□ 0.58
EXOSC7Q15024 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
EXOSC7Q15024 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
EXOSC7Q15024 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
EXOSC7Q15024 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
EXOSC7Q15024 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
EXOSC7Q15024 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
EXOSC7Q15024 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
EXOSC7Q15024 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
EXOSC7Q15024 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
EXOSC7Q15024 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms