Protein–RNA interactions for Protein: Q14714

SSPN, Sarcospan, humanhuman

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Length 243 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSPNQ14714 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SSPNQ14714 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SSPNQ14714 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SSPNQ14714 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SSPNQ14714 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SSPNQ14714 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SSPNQ14714 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SSPNQ14714 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
SSPNQ14714 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SSPNQ14714 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SSPNQ14714 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SSPNQ14714 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SSPNQ14714 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SSPNQ14714 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SSPNQ14714 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SSPNQ14714 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SSPNQ14714 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SSPNQ14714 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SSPNQ14714 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SSPNQ14714 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SSPNQ14714 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SSPNQ14714 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SSPNQ14714 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SSPNQ14714 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SSPNQ14714 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SSPNQ14714 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SSPNQ14714 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SSPNQ14714 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SSPNQ14714 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SSPNQ14714 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SSPNQ14714 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SSPNQ14714 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SSPNQ14714 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SSPNQ14714 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SSPNQ14714 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SSPNQ14714 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SSPNQ14714 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
SSPNQ14714 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SSPNQ14714 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SSPNQ14714 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SSPNQ14714 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
SSPNQ14714 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SSPNQ14714 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SSPNQ14714 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SSPNQ14714 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SSPNQ14714 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SSPNQ14714 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SSPNQ14714 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SSPNQ14714 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
SSPNQ14714 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SSPNQ14714 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SSPNQ14714 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SSPNQ14714 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SSPNQ14714 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SSPNQ14714 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SSPNQ14714 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SSPNQ14714 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SSPNQ14714 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SSPNQ14714 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SSPNQ14714 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SSPNQ14714 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SSPNQ14714 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SSPNQ14714 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SSPNQ14714 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SSPNQ14714 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SSPNQ14714 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SSPNQ14714 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SSPNQ14714 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SSPNQ14714 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SSPNQ14714 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SSPNQ14714 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SSPNQ14714 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SSPNQ14714 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SSPNQ14714 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SSPNQ14714 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SSPNQ14714 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
SSPNQ14714 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SSPNQ14714 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SSPNQ14714 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SSPNQ14714 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SSPNQ14714 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SSPNQ14714 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SSPNQ14714 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
SSPNQ14714 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SSPNQ14714 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SSPNQ14714 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SSPNQ14714 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SSPNQ14714 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SSPNQ14714 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SSPNQ14714 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SSPNQ14714 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SSPNQ14714 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SSPNQ14714 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SSPNQ14714 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SSPNQ14714 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
SSPNQ14714 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
SSPNQ14714 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
SSPNQ14714 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SSPNQ14714 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SSPNQ14714 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
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