Protein–RNA interactions for Protein: Q14011

CIRBP, Cold-inducible RNA-binding protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 172 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CIRBPQ14011 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CIRBPQ14011 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
CIRBPQ14011 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
CIRBPQ14011 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
CIRBPQ14011 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
CIRBPQ14011 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CIRBPQ14011 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CIRBPQ14011 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
CIRBPQ14011 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CIRBPQ14011 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CIRBPQ14011 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CIRBPQ14011 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
CIRBPQ14011 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CIRBPQ14011 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CIRBPQ14011 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CIRBPQ14011 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CIRBPQ14011 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
CIRBPQ14011 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
CIRBPQ14011 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
CIRBPQ14011 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CIRBPQ14011 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CIRBPQ14011 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
CIRBPQ14011 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CIRBPQ14011 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CIRBPQ14011 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CIRBPQ14011 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CIRBPQ14011 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CIRBPQ14011 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CIRBPQ14011 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
CIRBPQ14011 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CIRBPQ14011 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
CIRBPQ14011 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
CIRBPQ14011 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
CIRBPQ14011 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC13.93□□□□□ -0.18
CIRBPQ14011 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
CIRBPQ14011 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
CIRBPQ14011 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
CIRBPQ14011 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
CIRBPQ14011 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CIRBPQ14011 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CIRBPQ14011 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
CIRBPQ14011 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CIRBPQ14011 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
CIRBPQ14011 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
CIRBPQ14011 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CIRBPQ14011 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
CIRBPQ14011 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
CIRBPQ14011 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CIRBPQ14011 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CIRBPQ14011 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CIRBPQ14011 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CIRBPQ14011 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CIRBPQ14011 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
CIRBPQ14011 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CIRBPQ14011 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
CIRBPQ14011 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CIRBPQ14011 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CIRBPQ14011 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CIRBPQ14011 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
CIRBPQ14011 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CIRBPQ14011 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CIRBPQ14011 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
CIRBPQ14011 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CIRBPQ14011 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CIRBPQ14011 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CIRBPQ14011 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CIRBPQ14011 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CIRBPQ14011 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CIRBPQ14011 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CIRBPQ14011 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
CIRBPQ14011 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
CIRBPQ14011 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CIRBPQ14011 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
CIRBPQ14011 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
CIRBPQ14011 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
CIRBPQ14011 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
CIRBPQ14011 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
CIRBPQ14011 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CIRBPQ14011 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
CIRBPQ14011 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
CIRBPQ14011 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
CIRBPQ14011 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CIRBPQ14011 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
CIRBPQ14011 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CIRBPQ14011 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CIRBPQ14011 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CIRBPQ14011 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
CIRBPQ14011 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
CIRBPQ14011 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
CIRBPQ14011 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CIRBPQ14011 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
CIRBPQ14011 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CIRBPQ14011 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CIRBPQ14011 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CIRBPQ14011 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
CIRBPQ14011 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CIRBPQ14011 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
CIRBPQ14011 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CIRBPQ14011 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CIRBPQ14011 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
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