Protein–RNA interactions for Protein: Q13615

MTMR3, Myotubularin-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTMR3Q13615 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
MTMR3Q13615 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
MTMR3Q13615 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
MTMR3Q13615 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
MTMR3Q13615 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
MTMR3Q13615 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
MTMR3Q13615 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
MTMR3Q13615 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
MTMR3Q13615 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
MTMR3Q13615 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
MTMR3Q13615 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
MTMR3Q13615 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
MTMR3Q13615 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
MTMR3Q13615 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
MTMR3Q13615 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
MTMR3Q13615 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
MTMR3Q13615 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
MTMR3Q13615 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
MTMR3Q13615 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
MTMR3Q13615 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
MTMR3Q13615 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
MTMR3Q13615 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
MTMR3Q13615 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
MTMR3Q13615 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
MTMR3Q13615 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
MTMR3Q13615 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
MTMR3Q13615 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
MTMR3Q13615 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
MTMR3Q13615 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
MTMR3Q13615 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
MTMR3Q13615 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
MTMR3Q13615 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
MTMR3Q13615 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
MTMR3Q13615 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
MTMR3Q13615 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
MTMR3Q13615 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC21.73■■□□□ 1.07
MTMR3Q13615 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
MTMR3Q13615 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
MTMR3Q13615 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
MTMR3Q13615 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
MTMR3Q13615 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
MTMR3Q13615 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
MTMR3Q13615 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
MTMR3Q13615 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
MTMR3Q13615 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
MTMR3Q13615 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
MTMR3Q13615 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
MTMR3Q13615 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
MTMR3Q13615 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
MTMR3Q13615 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
MTMR3Q13615 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
MTMR3Q13615 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
MTMR3Q13615 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
MTMR3Q13615 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
MTMR3Q13615 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
MTMR3Q13615 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
MTMR3Q13615 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC21.72■■□□□ 1.07
MTMR3Q13615 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
MTMR3Q13615 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
MTMR3Q13615 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
MTMR3Q13615 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
MTMR3Q13615 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
MTMR3Q13615 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
MTMR3Q13615 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
MTMR3Q13615 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
MTMR3Q13615 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
MTMR3Q13615 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
MTMR3Q13615 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
MTMR3Q13615 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
MTMR3Q13615 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
MTMR3Q13615 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
MTMR3Q13615 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC21.71■■□□□ 1.07
MTMR3Q13615 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
MTMR3Q13615 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
MTMR3Q13615 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
MTMR3Q13615 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
MTMR3Q13615 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
MTMR3Q13615 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
MTMR3Q13615 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
MTMR3Q13615 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
MTMR3Q13615 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
MTMR3Q13615 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
MTMR3Q13615 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
MTMR3Q13615 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
MTMR3Q13615 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
MTMR3Q13615 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.07
MTMR3Q13615 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.07
MTMR3Q13615 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
MTMR3Q13615 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
MTMR3Q13615 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
MTMR3Q13615 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
MTMR3Q13615 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
MTMR3Q13615 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
MTMR3Q13615 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
MTMR3Q13615 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
MTMR3Q13615 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
MTMR3Q13615 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
MTMR3Q13615 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
MTMR3Q13615 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
MTMR3Q13615 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms